增值税留抵退税款，虽然同为税收返还款，但不同于个税手续费返还或4月1日前小规模纳税人享受的增值税3%减1%的性质。
前者为提前使用增值税留抵进项税额，而后者为税收优惠，性质不同
所以，入账科目不同，同时注意在现金流量表中填列的项目:
1. 税务核准的留抵退税数字后，计提:
借:应交税费-增值税留抵税额
贷:应交税费-应交增值税(进项税额转出)
2. 增值税留抵退税款打到公司银行账户后
借:银行存款
贷:应交税费-增值税留抵税额
3. 不符退税条件，将已收到的退税款交回
借:应交税费-应交增值税(进项税额) ——以后期间继续留抵扣
贷:应交税费-增值税留抵税额
借:应交税费-增值税留抵税额
贷:银行存款
根据2022年6月20日 财政部会计司2022年第二批企业会计准则实施问答 。
企业收到或缴回留抵退税款项产生的现金流量，属于经营活动产生的现金流量。
根据《企业会计准则》编制的现金流量表:在“收到的税费返还”项目列示。
根据《小企业会计准则》编制的现金流量表:在“收到其他与经营活动有关的现金”项目列示。
先收到留抵退税款后缴回，并继续按规定抵扣进项税额的留抵退税款，有关现金流量在“支付的各项税费”项目列示。