法律分析：区别在于：主要负责人是指一把手，负责人就是主管领导，是上下级的关系。主要负责人：具有领导职务的一把手，比如局长等。负责人：主管某一方面的领导职务的人，比如科长、主管财务的局长等。
法律依据：《中华人民共和国公务员法》
第十六条 公务员职位类别按照公务员职位的性质、特点和管理需要，划分为综合管理类、专业技术类和行政执法类等类别。根据本法，对于具有职位特殊性，需要单独管理的，可以增设其他职位类别。各职位类别的适用范围由国家另行规定。
第十七条 国家实行公务员职务与职级并行制度，根据公务员职位类别和职责设置公务员领导职务、职级序列。
第十八条 公务员领导职务根据宪法、有关法律和机构规格设置。领导职务层次分为：国家级正职、国家级副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。