对于经过改装但未办理合法手续的电动车，一旦被交警查处，可能会面临车辆被扣押的情况。根据《道路交通事故处理程序规定》第三十八条，公安交通管理部门会在与检验、鉴定机构约定的期限内完成检验和鉴定，这个期限最长不得超过六十日。超过二十日后，需经上级批准，但不得超过此期限。
在检验、鉴定结论确定后的五日内，交警会通知车主领取扣留的车辆及相关证件，如机动车行驶证和扣押物品。然而，如果遇到驾驶人逃逸或在通知后三十日内未领取的情况，车辆经过公告三个月仍未处理的，对扣留的车辆将依法进行处理。
相反，如果车辆拥有合法手续，车主可以携带这些手续到交警队办理手续，但在领回车辆前可能需要确保车辆恢复原状，因为交警部门并不具备长期扣押合法车辆的权利。