海南省疾病预防控制中心是一个拥有强大服务能力的机构，它内部设有9个处级部门和16个科级部门，共计235名员工。专业技术人员占据了职工总数的84.2%，其中中高级技术职称人员占48%，显示出中心的技术实力。本科及以上学历的员工占比高达79.6%，包括70.3%的本科学历和9.3%的研究生学历，还有8.4%的博士，可见其人才储备深厚。
中心的硬件设施同样先进，拥有16398平方米的办公和实验区域，其中6500平方米用于实验室。实验室配备的设备达到了国内领先水平，包括生物安全防护二级（P2）实验室和千级（局部百级）洁净实验室，确保了科研工作的高效进行。
在资质方面，中心在2006年就取得了中国国家认证认可监督管理委员会的计量认证证书和中国合格评定国家认可委员会的实验室认可证书。此后，通过2007年的第一次监督评审，中心的技术水平和能力得到了国际认可，达到了国内先进标准。其质量管理程序符合世界贸易组织（WTO）的规定，检验检测结果被广泛接受，确立了在海南省检验检测领域的主导地位。
海南省疾病预防控制中心是实施国家级疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的卫生事业单位。直属于海南省卫生厅， 2010年7月27日升格为副厅级事业单位。2007年通过了第一次监督评审，技术水平和能力达到了国内先进水平，质量管理程序符合世界贸易组织（WTO）规则要求，检验检测结果获得了国际认可，确立了中心在全省检验检测领域的优势地位。