会收走，但办完房产证后购房发票会还回来。因为在办理房产证的时候购房发票是重要的材料，所以房管局会查看购房发票的真伪，办完之后会把购房发票还给你。办理房产证材料还包括了房屋登记申请表、房屋平面图、房屋买卖合同、购房证明、契税完税证明以及申请人的身份证等。
购房发票用途如下：
1、用于办房产证：
如果没有购房发票，办理产权证的过程会更加繁琐。因为办理房屋产权证书需要的材料包括购房合同、申请人身份证、房屋登记申请表、购房全款发票以及其他相关文件，用以证明房屋已经完成资金交割，房子产权已经可以登记在购房人名下了。如果购房者无法提供意味着这套房子还没有交齐相关税费，就无法办理产权证。
2、用于提取公积金：
购房者如果想要提取公积金用于偿还房贷，就需要提供购房全款发票，证明房子已经全款到位，且房子已经归购房人本人所有，而没有购房发票就不能证明这种关系，无法正常提取公积金用于偿还房贷。
3、用于办理落户：
买房之后许多人想进行户口迁移，但是在办理落户的时候也是需要购房者提供购房合同和购房发票的。购房发票是很重要，但是有些开发商为了逃税避税而不给购房者开发票。如果遇到开发商迟迟不开购房发票的情况，购房者可以理直气壮地向他们索要。
4、出售自用不满五年自住房需要提供购房发票计算个税：
对于很多购房者来说，房屋买卖是十分常见的一种情况。在卖房环节，出售满五年且为家庭唯一住房时可免征交个人所得税，但是如果不满足条件，是需要承担成交总额的1%或者差价的20%作为个人所得税的。而在计算房屋差价是需要用到卖房人原始购房发票的，丢了购房发票，无法提供原始购房价格证明，卖房子时会比较麻烦。
法律依据：
《房产登记办法》 第二十五条
房屋登记机构应当根据房屋登记簿的记载，缮写并向权利人发放房屋权属证书。 房屋权属证书是权利人享有房屋权利的证明，包括《房屋所有权证》、《房屋他项权证》等。申请登记房屋为共有房屋的，房屋登记机构应当在房屋所有权证上注明“共有”字样。 预告登记、在建工程抵押权登记以及法律、法规规定的其他事项在房屋登记簿上予以记载后，由房屋登记机构发放登记证明。
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