非法集资的公司员工应该这样处罚：1、根据员工是否知情、在非法集资活动中扮演什么角色来判断，如果参与的，一般处三年以下有期徒刑并处罚金，情节严重的，处五年以下有期徒刑并处罚金；2、对于那些没有参与的公司员工，不知情的情况下，经公安机关认定不涉及到犯罪，是不需要判刑的。
【法律依据】：
《中华人民共和国刑法》
第一百七十六条 非法吸收公众存款或者变相吸收公众存款，扰乱金融秩序的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。
单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。
有前两款行为，在提起公诉前积极退赃退赔，减少损害结果发生的，可以从轻或者减轻处罚。