一是医疗资源总量不足，农村医疗资源分布不均衡，特别是我们国家确实存在着医疗资源不足和日益增长的人民群众对这个服务的需求。尤其是优质医疗资源分布不均衡，应该说是突出的。现在，70%的高新技术设备和优秀卫生人才集中在只有少数人口的大城市中的大医院，而我们在基层特别是农村，优质的医疗资源非常的不足。这是一个矛盾。
二是良好就医格局尚未形成。目前，我国还没有形成基层首诊、分级诊疗、双向转诊的有序就医秩序。致使一些常见病、多发病这些患者，我们叫小病，也纷纷到城市的大医院，所以现在有些城市的大医院确实是人满为患，由于大量的患者都集中在城市医院，可以说影响了它应有的作用。
三是医患双方沟通不够充分。大医院人满为患，医务人员负荷非常大，可以说是超负荷运转，压力过大，患者平均就诊时间最短的只有几分钟，医患之间缺乏充分的有效沟通。再加上确实存在着少数医务人员技术水平差、服务质量低、能力低，服务态度不好，甚至是责任心不强，所以患者和家属不满意，也是引发医疗纠纷的原因之一。
四是医疗保障水平还是比较低。我国基本医疗保障制度包括商业医疗保险起步是比较晚的，筹资标准也是比较低的，总体保障能力和水平不高。从目前看，2011年全国有1.73亿人次医疗费用支出超过家庭年收入的40%。患者看病自付比例较高，因病致贫、因病返贫的现象时有发生，尤其是那些钱也花了，但是病没看好，人也没了的患者家属，极易与医院产生医患矛盾。
五是医学的不完美性。无论是知识面、知识量和认识问题的深度、广度，任何一个人都是有局限性的。这恰恰与疾病的不确定性、个体的差异性、一些疾病的不可预知性形成了鲜明的对比。同时，医学是实践科学和经验科学，医学技能都是对以前临床实践经验的总结，医学具有不完美性和滞后性特点，也不可能做到"药到病除"。这也就是人们常说医生只能治病、不能"治命"的道理。
六是社会还尚未形成成熟的生命价值观。一些群众缺乏现代科学知识，尤其是缺乏医学常识。有些人对医学抱有不切实际的幻想，不能用成熟的心态对待治疗和死亡，对医院和医生抱有不切实际的苛求。一旦治疗失败，患者及家属不能理性接受，抱以怨言辱骂和殴打，甚至伤医杀医这些极端行为的发生。
七是也确实存在一些地方黑恶势力作祟。医患矛盾从表面看是发生在医院，是医生和患者的纠纷，但是从深层次看是社会矛盾在医疗卫生领域的反映。目前，一些地方的黑恶势力，利用医疗纠纷，寻衅滋事，扩大事端，甚至个别地方出现了职业“医闹”，进一步加剧了医患关系的恶化。
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