两者虽都是医学鉴定的手段，但不是一个概念，前者是通过书面材料进行鉴定，后者是通过生物样本进行鉴定，出鉴定结果时候这两个鉴定手段都会被考虑到。
但也有特殊情况，会单独以一种手段出结果。
不以病历为鉴定依据的情况：①病历已损毁。②病历造假。
不可以法医鉴定情况：①尸体或生物学证物已经超过可鉴定期限。
②患者或患者家属拒绝法医鉴定。
鉴定分医学会的医疗事故鉴定和司法鉴定机构的司法鉴定两种。
医疗事故鉴定，是指由医学会组织有关临床医学专家和法医学专家组成的专家组，运用医学、法医学等科学知识和技术，对涉及医疗事故行政处理的有关专门性问题进行检验、鉴别和判断并提供鉴定结论的活动。
司法鉴定是指在诉讼活动中鉴定人运用科学技术或者专门知识对诉讼涉及的专门性问题进行鉴别和判断并提供鉴定意见的活动。或者说，司法鉴定是指在诉讼过程中，对案件中的专门性问题，由司法机关或当事人委托法定鉴定单位，运用专业知识和技术，依照法定程序作出鉴别和判断的一种活动。
鉴定结果一般都要依靠医学的病历分析和法医学鉴定方法得到一个准确的分析结果。但如果不能尸检或者法医鉴定的情况下，医学会的医疗事故鉴定只能根据病历分析来给出一个鉴定结果。也就是法医的鉴定方法相对来说更具有法律说服力。
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