早起跑操的害处尤其是
空腹晨跑增加了血管中形成血栓的可能性，易导致血管栓塞，因为这时血液的
凝聚力提高了6%。 另外，晨跑时血压和心率上升以及
加速度均较大，易产生超负荷情况，影响运动效果及健康。而晚间体力和肢体反应的敏感及适应性均达高峰，心跳频率最平稳或偏低，运动而导致心跳增快和血压上升的幅度均较缓慢，对健康有利。晚跑还有促进睡眠更香的作用。
运动医学已经证明，早晨刚起来时，人体各脏器的运转仍处于较低水平，这时候锻炼，对于心血管功能比较脆弱的人来说是较危险的。而人体的活动能力在晚上被充分开发出来，这时候跑步，身体更容易适应运动节奏。
从外部环境来说，最新的研究表明，清晨空气中
二氧化碳指数最高，而且前一天悬浮在空中的尘埃也并未完全消失，这时候运动，远不如晚上的环境好。
早上6点多跑步，很多人可能不吃饭，于是又搜了下"空腹跑步":
空腹跑步会增加心脏及肝脏的负担，而且还极易出现
心律不齐，甚至导致猝死。