微信还在，但是微信聊天记录不会存在了。所以，在恢复出厂设置之前要先备份聊天数据，以苹果手机为例，方法如下：
1、首先，在手机屏幕桌面上，单击进入微信首页，如下图所示，然后进入下一步。
2、其次，完成上述步骤后，单击“我”，选择并单击“设置”按钮以进入设置页面，如下图所示，然后进入下一步。
3、接着，完成上述步骤后，在设置页面中找到通用选项并单击，如下图所示，然后进入下一步。
4、然后，完成上述步骤后，单击“聊天记录备份与迁移”选项，如下图所示，然后进入下一步。
5、随后，完成上述步骤后，选择将聊天记录转移到另一台设备，如下图所示，然后进入下一步。
6、接着，完成上述步骤后，可以根据需要选择迁移所有聊天记录或部分聊天记录，如下图所示，然后进入下一步。
7、最后，完成上述步骤后，弹出二维码，用手机登录微信，并通过微信扫描转移聊天记录，以完成微信聊天记录的恢复，如下图所示。这样，问题就解决了。
手机恢复出厂设置后，手机的信息会被全部清空的，包括微信等应用的数据都会被清空的。如果用户想换手机，又想保留微信原来的数据，可以在恢复出厂设置前使用微信聊天记录迁徙功能，具体如下：
1、旧手机桌面找到微信并点击打开；
2、进入微信后点击我，然后点击设置；
3、在设置菜单中找到聊天点击进入；
4、在聊天记录点击聊天记录备份与迁移；
5、选择迁移聊天记录到另一台设备；
6、选择自己需要迁徙的聊天记录；
7、如果不用分的话，直接全选，然后点击完成；
8、用新手机的微信扫描迁移二维码，即便进行数据迁移了。
说明
1、迁移的时候在另外一部手机登录自己的微信扫二维码的过程是不会挤下线的。
2、迁移过程最好保持网络环境正常，避免造成数据丢失。
因为恢复出厂值只是删除你手机本地存储的信息，而微信收藏是存储在微信服务器的，因此并不影响。但建议恢复出厂值前备份好手机内的信息，以免丢失。
这个得看你备份的时候的情况了还有就是你备份用的软件勾选的备份数据有哪些。
如果是用手机系统自带的备份功能，而且勾选了应用数据的话，那应该还是有的。如果是第三方软件一般不会有。
恢复出厂设置是指：设置恢复到出厂时的默认状态，如开始界面，待机方式，操作快捷键，定时提醒等功能恢复，清除保存的参数设置。
对铃声、主题、情景模式、闹钟、字体的一些设置恢复到出厂状态。不会删除在存储卡如下载的应用程序或者SIM卡如短信，等内容。
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