基本农田上建房子是禁止的，一定会被拆除。
在我国，实行基本农田和耕地保护制度，任何单位或个人在基本农田上修建房屋都是被禁止的。自然环境资源部门可以采取限期拆除、处以罚款等措施。在建立基本农田保护区的地方，县级以上地方人民政府应当与下一级人民政府签订基本农田保护责任书；乡、镇人民政府应当根据与县级人民政府签订的基本农田保护责任书的要求，与农村集体经济组织或村民委员会签订基本农田保护责任书。
此外，农民宅基地也受到政策的约束。农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。在人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级人民政府在充分尊重农村村民意愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。农村村民出售、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。
在宅基地制度改革方面，开展了多项试点工作，包括农村土地征收、集体经营性建设用地入市、宅基地制度改革等。深化农村土地承包经营制度改革，健全耕地保护和补偿制度。坚守土地公有性质不改变、耕地红线不突破、农民利益不受损“三条底线”，防止犯颠覆性错误。