水电被广泛认为是一种对环境友好的、无污染的可再生资源。然而，这种能源的开发并非没有环境影响。首先，常规水电工程的建设可能会破坏河流的连续性。水库的蓄水不仅改变了水的化学、物理和生物特性，还可能减少流水携带的沉积物，从而引发下游河岸坍塌和河床下切的问题。
其次，水坝的建设虽然不增加泥沙总量，但会改变水流输沙的能力和过程，导致泥沙淤积，这不仅影响水电站的发电效率，也可能对下游生态环境和人民的生活安全构成威胁。此外，水库淹没区域的原生森林和生物多样性丰富的地区将遭受损失，许多珍稀和濒危物种的栖息地将不复存在，对全球生物基因库造成巨大损失。
水电开发还可能引发地质灾害，如水库诱发地震和滑坡。在施工过程中，水电工程可能会触及自然保护区、风景名胜区、水源保护区等生态敏感区，对这些自然遗产的保护成为开发中必须面对的重要问题。
最后，水电开发改变了库区和下游的生态系统状况，包括水流、水温、气候、地质和植被等方面，这破坏了生态平衡。同时，水库淹没土地是不可避免的，对耕地的影响尤其值得关注。因此，尽管水电是一种可再生能源，但其开发对环境的影响也不容忽视。
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