晚期梅毒，也称后天性梅毒，根据病变进展的不同阶段分为早期和晚期。早期梅毒（一期和二期）未得到妥善治疗或治疗不彻底，会在感染后2年以上发展成晚期，通常在感染后的3-4年较为常见，病程漫长，可持续10至30年。
未经治愈的二期梅毒中大约有三分之一的患者会进展为运动性晚期梅毒。部分病人可能没有明显晚期症状，但血液检查显示梅毒血清阳性，称为潜伏性晚期梅毒。也有一部分病人可能在治疗后恢复。然而，晚期梅毒的破坏力不容忽视，它不仅会侵犯皮肤和黏膜，形成梅毒性结节和树胶肿，还会侵犯神经系统、心血管以及内脏和骨骼等器官。
神经性晚期梅毒的典型症状包括皮疹、黏膜损害，骨骼的树胶肿，以及眼部问题，如虹膜睫状体炎、视网膜炎和角膜炎。大约有15%的患者会侵犯皮肤、软组织和骨骼，约10%至25%会侵及心血管系统，而10%则会侵犯神经系统，可能引发脑实质损害，表现为麻疹性痴呆和脊髓痨。当视神经受到侵犯时，可能会导致神经萎缩。值得注意的是，晚期梅毒的传染性相对较低，但仍需引起高度关注。
梅毒罗旋体侵入了中枢神经系统就是神经梅毒。表现因侵犯的部位而不同。如侵犯视神经则可引起视力下降或失明、语音神经则引起语言障碍、有的还会出现痴呆。梅毒是大型螺旋菌感染所引起的慢性传染病，其病原体是德国的霍夫曼和谢文定在1905年首先发现。梅毒的感染大都是因为和带菌者有直接的性行为，例如性交、爱抚、接吻等，但是从事医疗工作的医师、护士有时也会从外伤而感染病毒；输血时也有可能感染；怀孕中的妈妈，会经由胎盘把病原体传染给胎儿，造成婴儿先天性的梅毒。