很简单，传输速率有区别。
你口中所谓的“SATA接口6.0”，正确叫法为“SATA3.0”或“SATA3.1”，当然，3.1和3.0属于同一代技术规范。这种接口，最高传输速率为6Gb/s，理论上每秒钟最高可传输750MB的数据。
而“SATA接口3.0”，正确叫法为“SATA2.0”。这种接口，最高传输速率为3Gb/s，理论上每秒钟最高可传输375MB的数据。
当然，由于传输过程中存在损耗，要打些折扣，达不到上述的理论值。
实际使用中，如果安装固态硬盘，这两种接口区别还是很大的，SATA3.0接口最高读写速度可双双突破500MB/s甚至逼近600MB/s，而SATA2.0接口的最高读写速度低于300MB/s。因此，如果你使用的是固态硬盘，一定要将其连接到SATA3.0接口（即你所谓的6.0接口）上。
如果使用的是机械硬盘，由于连续读写速度通常都低于200MB/s，因此，机械硬盘接到这两种接口上都差不多，SATA3.0接口无非硬盘缓存到内存的突发传输速率高一些罢了。