日本首相更迭频繁究其根本愿意还是由于日本的政治体制不健全造成的。日本首相并不是由选民直选，而是在党内产生，而党内又是由最大派阀产生。这就形成了日本政界的“55体制”。依在下个人见解日本首相经常轮换有以下原因。
日本采用议会君主立宪制政体，在国会众议院拥有过半数席位的党派可获单独组阁权利，该党派领导人即为内阁总理大臣。现日本自民党在国会众议院拥有多数席位，那么自民党总裁即为首相。
日本首相的更迭频繁主要因为“考试”太多，哪一场“考试”没通过都会有倒台的危险。
在下本人总结了以下几点原因：
1.众议院选举失利（别说是首相职位连执政党的地位都保不住，1993年宫泽喜一首相因此倒台，自民党也丧失了50多年来执政党地位。）
2.参议院选举失利，虽然众议院可以再次通过三分之二以上的赞成票否决参议院，但会使决议的通过耗费很长时间。如果参院由在野党领导那么会直接威胁执政党地位，况且如日本银行行长等职务必须经两院同时赞成。（2007年安倍晋三首相的辞职原因之一就是因为参院选举失利。）
3.《日本国宪法》没有对内阁总理大臣一职的任期作明文规定，但现在执政的自民党总裁的任期为3年可连任一届，也就是说日本首相的任期最多为6年。去年安倍首相在任职一年后辞职，那么接替他的福田首相的任期就是安倍首相未完成的2年。照此推断，下任首相的任期只有一年，如果他明年谋求连任并在党总裁选举中获胜，并且自民党在9月的众院大选中获胜，那么他的任期也最多只有4年。（上任首相的任职对下任首相的任期产生直接影响并有连锁反映）
4.国会两院通过不信任案，首相必须解散众议院举行大选或辞职。（日本首相因此辞职的不多，不过今年意大利总理普罗迪就是因此辞职的。）
5.国会两院通过问责案，对首相任职内的一些举措提出质疑（福田首相辞职前，由民主党控制的参议院就通过了对福田首相的问责案）
6.一些重大决议案未获国会通过，如财政预算等。（二战后至93年一直由自民党控制众议院，类似案例在下未知）
7.内阁大臣或身边阁僚出现某种问题（如铃木善幸、安倍晋三、福田康夫等任内的内阁大臣纷纷出现政治献金问题，口无遮拦问题，安倍首相任内这样的问题最严重）
8.首相本人出现问题（田中角荣首相因“洛克希德受贿案”而辞职并入狱）
9.国民支持膟过低（安倍首相、福田首相、森喜朗首相等）
10.一些政府决策遭国民严重反对（岸信介首相因“旧金山和约”遭民众严重反对而辞职）
11.派阀斗争严重，日本首相并不是国民最喜欢的人和最有才能最有领导能力的人出任，自民党内一般由实力最大的派阀推举出党总裁，这个总裁一般也都是党内各派阀都能够接受的人选。不需要党派间的竞争，而是自民党内派阀间实力斗争的产物-即“55体制”（自民党自55年起执政）。自民党现今最大派阀为森喜派，福田、安倍、小泉、森喜朗等多位首相均出自该派阀（三木武夫首相、铃木善幸首相因自身派阀实力较小而辞职，麻生三度竞选首相失利也是因此）
12.日本首相的工作压力很大很繁忙，小泉曾说：“任首相五年间我从没睡过一个安稳觉。”（安倍首相曾累出胃病，小渊汇三首相因健康问题辞职2个月后病逝，大平正方首相更是因忙于选举而突发心脏病死在任上）
13.日本国民较为注重个人魅力，喜欢有特点的领导人（如小泉虽政绩不佳特别是外交，但人气颇高）
14.日本政界领导人背后均有大企业、大财阀支持，如各大财阀之间出现利益冲突也会影响政局动荡。
福田首相辞职原因依在下之愚见有以下几点：
1.在野党控制参院阻碍一些决议通过。
2.日本国内经济萧条，通货膨胀严重，政府无得力措施。
3.政府官员腐败问题严重，说话言辞方面欠妥，丑闻频出。
4.参议院通过对福田首相的问责案。
6.政府财政拮据不得不加大税收，引起国民不满。
7.民众认为福利过低（当然，日本的福利要比中国高出几十倍）
当然还有一条在下认为，福田首相已72岁高龄不适合任首相一职。他在上任伊始曾说：“我年事已高不适合出任内阁总理一职，但现今党和国家处于为难当中，我必须肩负起这个责任。”
日本的“短命”首相有很多，只是前几年小泉的任职时间长了一些，如前首相羽田兹，东久尔仅在任一个多月，细川、海部、安倍、福田等在职一年，小渊、森喜朗、桥本、村山等在职也不过2年。目前为止：
东久迩稔彦Higashikuni Naruhiko（王室成员，亲王爵位）1945年8月17日-1945年10月9日期间任日本国第43任内阁总理大臣，在职仅54天为日本战后在职时间最短的首相。
佐藤荣作 Sato Eisaku于1964年11 月9日-1970年1月13日任日本国第61、第62、第63任内阁总理大臣，在职2798天3度出任首相一职，为日本战后在职时间最长的首相。
建议阁下参考以下资料：
《日本首相列传》《日本政治与外交》《日本国会与政治》《日本外交三十年》《出使东瀛》《首脑外交-中日关系》等
《日本国宪法》全文：
http://baike.baidu.com/view/447279.htm 有关网站：
日本内阁府官方网
www.cao.go.jp 日本国驻华大使馆官网
www.cn.emb-japan.go.jp 日本政府官网
http://nettv.gov-online.go.jp/日本首相官邸（永田町）官网
www.kantei.go.jp