企业集团内部存货交易应属关联方交易，可能产生关联交易差价。如果产生关联交易差价后，母公司在编制合并会计报表时，一方面要抵销内部存货交易额和内部存货交易包含的未实现内部销售利润；另一方面还要抵销内部存货交易中产生的关联交易差价，从而使合并资产负债表中存货项目的合并数反映该存货在内部交易发生前的成本。由于母公司产生的关联交易差价与子公司产生的关联交易差价在个别报表中的确认不同，因此，内部存货交易中母公司产生的关联交易差价与子公司产生的关联交易差价的抵销处理也不一样。
1、母公司产生关联交易差价的抵销（顺销）包括两种情况：
一是交易首期的抵销。在内部存货交易发生后的第一个会计期间，母公司编制合并会计报表时，一方面要将母公司对子公司的销售收入与母公司的销售成本和子公司购入的存货中包含的未实现内部销售利润予以抵销，另一方面还要将因关联方交易导致母公司资本公积的增加数同子公司购入的存货中包含的未实现关联交易差价予以抵销。
二是以后各期的抵销。在内部存货交易发生后的第二个或以后各个会计期间，母公司编制合并会计报表时，一方面要抵销期初存货中包含的未实现内部销售利润和未实现关联交易差价对年初未分配利润的影响；另一方面还要抵销期末存货中包含的未实现内部销售利润和未实现关联交易差价对年末未分配利润的影响。
2、子公司产生的关联交易差价的抵销（逆销和平销）。由于母公司的子公司有全资子公司和非全资子公司之分，而在非全资子公司的情形下，无论子公司将存货出售给母公司还是其他子公司，只要子公司产生关联交易差价，则母公司在编制合并会计报表的抵销分录时，与母公司产生的关联交易差价抵销处理的不同之处在于：一方面要将子公司内部交易存货中包含的未实现关联交易差价对母公司资本公积和少数股东权益的影响数予以抵销；另一方面还要将子公司因关联交易产生的未实现内部销售利润对少数股东权益和少数股东收益的影响予以抵销。
（1）交易首期的抵销：
①抵销内部存货交易额以及内部交易存货包含的未实现内部销售利润与未实现内部关联交易差价；
②抵销内部交易存货包含的未实现内部销售利润对少数股东收益和少数股东权益的影响。
（2）以后各期的抵销：
①抵销年初存货包含的未实现内部销售利润与未实现关联交易差价；
②抵销年末存货包含的未实现内部销售利润与未实现关联交易差价。
