二者没办法比较。
主任医师是职称，有的就直接等同职务了。三级主任医师是岗级。在一个有岗级的单位，将主任医师分成几个等级。
级别只是医院内部的安排和设定，主任医师是医师职称而级别是不同医院的设定。
主任医师(Chief Physician)是医生职称的一种，当前是医生职称中的最高级别，属于正高级别。简称为“主任”，一般冠以姓氏。部分主任医师，同时也被评为“教授”职称，承担一定的科研与教学任务。
扩展资料：
医师职称等级包括：
1、初级职称（医士、医师/住院医师)：中专或大专刚毕业职称是医士、考得执业医师证自动晋升为医师，医士和医师都称为初级职称。
2、中级职称（主治医师）：从事医师工作本科四年、硕士二年、专科六年可以考主治医师，考试合格自动晋升为主治医师（中级职称）。
3、副高级职称（副主任医师）：本科或硕士毕业获得中级职称后五年，且各项条件合格可以评副主任医师，博士毕业中级职称后三年可以评副主任医师。
4、正高级职称（主任医师）：本科或硕士毕业副高职称后五年各项条件合格可以评主任医师，博士毕业副高职称后三年可以评主任医师。
参考资料来源：百度百科—主任医师
级别只是医院内部的安排和设定，主任医师是医师职称而级别是不同医院的设定。我国对于医生职称有专门规定，具体分类如下：
医师职称等级包括：
1.初级职称（医士、医师/住院医师)：中专或大专刚毕业职称是医士、考得执业医师证自动晋升为医师，医士和医师都称为初级职称。
2.中级职称（主治医师）：从事医师工作本科四年、硕士二年、专科六年可以考主治医师，考试合格自动晋升为主治医师（中级职称）。
3.副高级职称（副主任医师）：本科或硕士毕业获得中级职称后五年，且各项条件合格可以评副主任医师，博士毕业中级职称后三年可以评副主任医师。
4.正高级职称（主任医师）：本科或硕士毕业副高职称后五年各项条件合格可以评主任医师，博士毕业副高职称后三年可以评主任医师。