六味地黄丸对因肝肾阴虚引起的下列病症，均有明显的治疗和改善症状作用，主要包括：
（1）内科类：肺结核、肺心病、支气管哮喘、原发性高血压、慢性肾性高血压、冠心病、室性早搏、脑血栓形成、脑出血后遗症、慢性肾炎、肾病综合征、肾及输尿管结石、慢性前列腺疾病、肿瘤、白细胞减少证、嗜酸性粒细胞增多症、慢性血小板减少性紫癜、早期食管上皮细胞增生证、肾阴亏损性糖尿病、甲状腺机能亢进、神经衰弱以及老年性痴呆、顽固性失眠、慢性食管炎、一氧化碳中毒性精神病、手术后顽固性呃逆、萎软（格林巴里综合症）等见六味地黄丸症候者。
（2）外科类：骨结核、血栓性脉管炎、男子乳房发育、肠风下血（痔疮）、食道癌手术后复发、脱发、皮肤皲裂、鹅掌风、阴囊湿冷、小便不快等。
（3）妇科：更年期综合症、黄褐斑、功能性子宫出血。
（4）儿科：小儿发育不良、小儿疳积、小儿呼吸道反复感染、小儿尿频、抽动-秽语综合症、遗尿症等。
（5）眼科：中心性视网膜脉络膜炎、青光眼、老年性白内障、玻璃体积血、老年性黄斑盘状变性、外伤性角膜溃疡、睫状体炎、慢性葡萄膜炎等。
（6）五官科：复发性口疮、慢性咽喉炎、慢性扁桃体炎、牙周脓肿、冠周炎、喉痹等。
（7）使用六味地黄丸还可增强化疗效果，辅助治疗肿瘤、癌症，减少化疗毒副反应。
六味地黄丸源自医圣张仲景的“金匮肾气丸”，是治疗小儿发育不良的药品，因此这服药是比较平和的药品。由于中医有补肾可以健脑的说法，因此在医药界有六味地黄丸可以让思维敏捷的说法。更有很多人还坚持长期服用，专家提醒，六味地黄丸虽然对人体有益，但服用不当也同样会带来一些副作用。
据陕西中医研究院的专家魏主任介绍，六味地黄丸属甘温性，偏于补阴的药，主治肾阴虚。由于配方中阴柔的药多一些，所以吃后有时候会妨碍消化功能，因此脾胃功能弱、消化不良者慎吃。服用两周后如果效果不明显，可能是选药不对症，可以找一位中医大夫对身体的症状进行诊断，对症选药。与六味地黄丸相同功效的知柏地黄丸，还能治疗火旺，如手心和脚心烦热、口燥咽干，舌尖红，有清热作用。
传统中医学认为，中药的药效如何和选用何处出产的药材，是否地道，有很大的关系，所谓“药材好、药才好”。比如年初刚获中国驰名商标的仲景六味地黄丸，因主药--山茱萸选自素有“天然药库”的伏牛山，而保证了其药效要比一般普通的六味地黄丸高出许多。
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