一、性质不同
1、隐性基因：一种等位基因，只有该基因是纯合时，其决定的性状才会表达出来。
2、显性基因：无论该基因是纯合的还是杂合的，它都会被表达出来。
二、与遗传的关系不同
1、隐性基因：纯合子的基因要么是双显性要么是双隐性。如果显性用大写字母表示，隐性用小写字母表示，AA组合的纯合子为显性纯合子，aa组合的纯合子为隐性纯合子，而一个大写和一个小写组合的Aa就是杂合子。杂合子表现出由显性基因决定的性状，这是显性基因的“优先权”。
2、显性基因：显性基因控制显性性状的等位基因。在二倍体生物中，在杂合子状态下可以表现为表型的基因称为显性基因。显性基因往往形成功能物质（如酶），而显性基因的隐性等位基因由于相应核苷酸的突变而不能产生这种物质，因此只有杂合子中的显性基因才能发挥正常功能（显性）。
扩展资料：
显性基因用大写字母表示。例如（Xx）：这里X代表显性野生型等位基因，而x代表隐性突变体等位基因。
1、（XX）：纯合显性（X表型-野生型）
2、（Xx）：杂合（X表型-野生型。显性等位基因掩盖了隐性等位基因的表达）。
3、（xx）：纯合隐性（x表型-突变体表型）
参考资料来源：百度百科-隐性基因
参考资料来源：百度百科-显性基因
1、表示方法不一样
显性等位基因通常用大写字母表示。例如（Xx）：这里X代表显性野生型等位基因，而x代表隐性突变体等位基因。
隐性基因用小写字母表示，如果该基因显性纯合子表示为AA，则隐性纯合子表示为aa。
2、产生的物质不一样
显性基因常能形成一种有功能的物质（如酶）。
隐性等位基因则由于相应的核苷酸发生了突变而不能产生这种物质，所以在杂合体中只有显性基因能表现出正常的功能（显性）。
3、遗传病的遗传：
显性遗传病(AA或Aa)的意思就是患不患病由显性基因A决定，即：只要有一个A，就是显性，便患病．AA，Aa都患病。
而隐性基因aa无致病基因，不会患病。
参考资料来源：百度百科-隐性基因
本回答被网友采纳隐性基因：控制隐性性状的基因
具有一对【相对性状】的【纯合】亲本进行杂交,子一代为杂合体。子代表现出的性状和【其中一个】亲本的性状一样，叫做【显性性状】，那么控制显性性状的基因就定义为【显性基因】。另一个亲本的性状就是【隐性性状】，它的基因就是【隐性基因】。本回答被网友采纳
1，染色体都是成对的，所以基因也是相映成对的，所以会有两个基因控制一个性状，比如控制眼睛颜色A和a
2，如果是AA组合，必然显示A的性状，同理aa显示a性状
3，AA和aa会生下Aa，如果显示A性状，则A是显性，a是隐性，显示a性状，则a是显性，A是隐性