（一）事业单位采用权益法核算长期股权投资、且被投资单位编制合并财务报表的，在持有投资期间，应当以被投资单位合并财务报表中归属于母公司的净利润和其他所有者权益变动为基础，计算确定应当调整长期股权投资账面余额的金额，并进行相关会计处理。
（二)事业单位以其持有的科技成果取得的长期股权投资，应当按照评估价值加相关税费作为投资成本。事业单位按规定通过协议定价、在技术交易市场挂牌交易、拍卖等方式确定价格的，应当按照以上方式确定的价格加相关税费作为投资成本。
（三）事业单位处置以科技成果转化形成的长期股权投资，按规定所取得的收入全部留归本单位的，应当按照实际取得的价款，借记“银行存款”等科目，
按照被处置长期股权投资的账面余额，
贷记“长期股权投资”科目，
按照尚未领取的现金股利或利润，
贷记“应收股利”科目，
按照发生的相关税费等支出，
贷记“银行存款”等科目，按照借贷方差额，
借记或贷记“投资收益”科目；
同时，在预算会计中，
按照实际取得的价款，
借记“资金结存-货币资金”科目，
按照处置时确认的投资收益金额，
贷记“投资预算收益”科目，按照贷方差额，
贷记“其他预算收入”科目。
（四）权益法下，事业单位处置以现金以外的其他资产取得的（不含科技成果转化形成的）长期股权投资时，按规定将取得的投资收益（此处的投资收益，是指长期股权投资处置价款扣除长期股权投资成本和相关税费后的差额）纳入本单位预算管理的，分别以下两种情况处理：
1。长期股权投资的账面余额大于其投资成本的，应当按照被处置长期股权投资的成本，
借记“资产处置费用”科目，
贷记“长期股权投资-成本”科目；
同时，按照实际取得的价款，
借记“银行存款”等科目，按照尚未领取的现金股利或利润，
贷记“应收股利”科目，按照发生的相关税费等支出，
贷记“银行存款”等科目，按照长期股权投资的账面余额减去其投资成本的差额，
贷记“长期股权投资-损益调整、其他权益变动”科目（以上明细科目为贷方余额的，借记相关明细科目），按照实际取得的价款与被处置长期股权投资账面余额、应收股利账面余额和相关税费支出合计数的差额，
贷记或借记“投资收益”科目，按照贷方差额，
贷记“应缴财政款”科目。
预算会计的账务处理按照《政府会计制度》进行。