阿古柏当初也是一个昏君，贪图美色，我感觉左宗棠对他的子女不是全部杀掉，要不然就是发配回家，再要不然就是沦为奴隶。
朝廷当时虽然已经接纳了左宗棠攻打新疆的建议。但给左宗棠的经费却少之又少，只有500万两。这些钱在当时根本不够。最终，左宗棠只能自己筹钱，向洋商人借了1375万两，向华商借了846万两。不只是钱不够，朝廷当时也没有足够的兵力、足够的粮食、足够的武器供给左宗棠。最终，兵力大部分都是左宗棠自己招募的，粮食也是左宗棠花了一年的时间生产筹集的，武器也是左宗棠设立甘肃制造局自己造的。
做完这些准备，钱都快用完了。左宗棠根本就没有物资储备。再加上新疆地区地广人稀，路线非常长，左宗棠也没有办法获得就地补给。所以，和沙俄的仗，没办法打下去。
据历史记载，当时那一年内左宗棠就借了将近于500万两得军费，于是在当时后勤得到了极大的保障，粮草虽然是搞定了，军械还是一个重大的因素，俗语又说，工欲善其事，必先利其器，打新疆必须要武器精良，左宗棠不愧是一代开明之人，他在出征前进行了特种的练兵，非常有效的锻炼了本来就很厉害的湘军，还派了智囊团到西洋大量的采购了世界最先进的武器装备，最聪明的是把采购最新型的武器也进行了仿造，（让西安兰州机器局进行大量仿制以供战备），就这样，一只正义的武装到牙齿的湘军，在一个勇武的大将的带领下，浩浩荡荡的开往新疆，收复新疆之战开始了。
左宗棠收复新疆，俘虏阿古柏子孙和女眷，是怎么处置他们的左宗棠收复新疆，俘虏阿古柏子孙和女眷，是怎么处置他们的左宗棠收复新疆，俘虏阿古柏子孙和女眷，是怎么处置他们的
左宗棠打败阿古柏之后，当时阿古柏的儿子们依旧控制着南疆，而且他们还与清廷相对抗。最后左宗棠也打败了他们，最终左宗棠在喀什将阿古柏所有子女都处决了。
阿古柏原本是通过政变扶持布素鲁克在新疆建立了哲德沙尔汗国，虽然布素鲁克是大小和卓的后人，并且他自己还号称为“圣裔”，但是在哲德沙尔汗国中，他只是一个傀儡，他的上位是阿古柏一手扶持。由于阿古柏具有很高的军事才能，在新疆内乱时期，阿古柏打败了很多新疆地方势力，最后将新疆收入囊中。这个时候，阿古柏也不甘心做一个权臣，最后他废掉了布素鲁克的汗位，并且建立了自己的帝国洪福汗国。
当时清朝意识到阿古柏侵占新疆事态严重之后，便派左宗棠攻打阿古柏并且要收复新疆。当时阿古柏正是春风得意之时，他还得到了西方列强的支持，他没有想到在新疆战场上所向披靡的自己会被大清的左宗棠打败，后来左宗棠节节胜利，阿古柏便率众往南逃亡。这个时候，左宗棠已经将北疆完全收复，而阿古柏后来也死于库尔勒。
虽然阿古柏已经死了，但是当时南疆还在阿古柏的儿子手中。阿古柏去世后，他的儿子伯克·胡里便即位，而且依旧与大清朝廷相对抗。而之前一直支持阿古柏的西方列强们也在背后支持他的儿子，左宗棠再次出击南疆阿古柏的残余势力，很快就将他们打败。最后左宗棠便将阿古柏所有的子女和勾结阿古柏的卖国贼等一些人都处决了。
不是杀掉，就是卖掉，要不然就发配。我觉得左宗棠所得对，毕竟阿古柏这件事情必须起到杀一儆百的作用。所以一定要严惩。