南京市干部保健卡的待遇如下：一、副省级以上干部和享受副省级医疗待遇的干部，包括相当于此级的知名人士、科技专家发给带有“保健”字样的特约医疗证，因病可在特约门诊室就诊，住院安排干部病房，日常保健工作由省级机关医院保健医师负责，建立保健档案，每年体检一次。
二、红军干部、现职厅、
局级干部（包括离休后享受厅局级待遇的干部）和正职高级专业技术干部，发给特约医疗证，因病至定点医院的特约门诊室就诊，可收住干部病房，每年体检一次。
三、建国前参加革命的离休干部，发给带有“门诊”字样的特约医疗证，因病至定点医院的特约门诊室就诊，可优先安排收住普通病房，每年体检一次。
四、副职高级
专业技术职务的科技干部，发给优先医疗证，因病凭证至定点医院的
普通门诊优先挂号、就诊、取药，可优先收住普通病房，每两年体检一次。
五、其他机关干部和职工，发给公费医疗证到定点医院就诊，住普通病房，每两年体检一次。