仲景对外科病证也有着深刻的研究。如他说：“诸浮数脉，当发热，而反洒淅恶寒，若有痛处，当发其痈。”这是他从经验中总结出来的诊断痈肿的原则。他对肠痈和肺痈作了比较正确的描述，而且确立了有效的疗法。比如肠痈(大致相当现代医学的阑尾炎)一证，他不但对其发病过程，各个时期的症状等都作了较具体而确切的描述，而且提出了两个很有效的方剂——大黄牡丹皮汤与薏苡附子败酱散，至今仍有效地运用于治疗阑尾炎。从现代医学来讲，一旦确诊为阑尾炎，即禁用泻剂，而大黄一药，历来认为有明显的泻下作用，即使少用也有轻微的泻下作用，但据现代药理实验研究，微量的大黄却有减少肠蠕动的作用。由此可见，仲景治疗阑尾炎创用大黄牡丹皮汤是很有科学道理的。