第一任妻子，简·怀尔德是霍金就读剑桥大学研究院时期认识的，两人相识在一个新年派对里，当时，怀尔德正准备进入伦敦大学就学，彼时的霍金风趣幽默，性格独立且学识渊博，这些优点强烈地吸引着怀尔德。
此时的霍金，已经开始出现了渐冻症的征兆，虽然还没有被确诊，但是身体上已经传递出生病的信号。“渐冻症”三个字，代表的是不治之症，因为医学上没有特效药可以救治这类患者，他们通常只能活两到三年，最后死于肺炎或呼吸肌肉失效导致窒息。
但怀尔德并没有因为霍金的病情而离开他，相反，作为对上帝有虔诚信仰的教徒，她认为这是上帝派给她的使命，让她来照顾霍金。1965年，怀尔德嫁给了霍金。
婚后，霍金从事于研究员的工作，此时的怀尔德还学业未成，两个人分居两地，只有周末才能见面，相聚的时间很少。为了解决两地分割的现状，他们在应用数学与理论物理系的大楼附近租到一间住屋，方便霍金上班，为了解决交通问题，他还买了一辆三轮机动车，可以驾驶到剑桥附近乡下的天文学学院办事。霍金虽然患病，但有了怀尔德的陪伴，在外人看起来依旧生活美满。
怀尔德硕士毕业后，独立的她决定继续留在伦敦大学攻读博士学位，专门研究评论中世纪西班牙古书。果然是学霸的妻子，在学术上的追求不输丈夫霍金。两个人做研究的做研究，求学的求学，没有耽误家庭生活。相继地，霍金的大儿子罗伯特诞生，女儿露希生于1969年，十年后小儿子提摩西出生。
霍金不愿意被病人的眼光看待，他更愿意别人称他为科学家，在事业上他有抱负有梦想，所以他跟妻子简·怀尔德也很少抱怨自己的身体障碍。家庭里的大事小事都是简·怀尔德一个人处理，霍金一门心思思考学术问题。一天24小时，一年365天，自从简·怀尔德跟霍金在一起之后，她就开始了这样日复一日照顾丈夫的生活，带霍金去各地旅游，还要照顾3个孩子的生活，一家5口的家务也都是她一个人操持。整整25年她陪伴霍金、照顾霍金，霍金也从一个研究生成为了享誉全球的伟大科学家。简·怀尔德并不是没有抱怨，霍金对于知识的无限渴求，让他对周遭的实物视若不见。简·怀尔德曾表示，他们的大儿子10岁起就开始照顾父亲霍金，她认为这不是一个孩子该有的童年生活。
年复一年，日复一日地照顾丈夫，使怀尔德感到疲惫。一直到1974年，霍金获聘去加州理工学院做研究，研究生柏纳德·卡尔随行，负责照顾霍金，怀尔德才暂时拥有了一段自由时间。
分别的时间里，可能会发生很多事情，比如他人的介入。
怀尔德在1977参加圣马克教会的合唱团，遇到管风琴演奏家强纳森·琼斯。两个人渐生情愫，发展出一段浪漫的柏拉图友情。霍金得知后，非常不开心，但又无可奈何，只能很勉强地接受了这现实，只要简继续爱他。怀尔德也不忍抛下这个来之不易的家庭，很长一段时间里，她和新恋人也仅仅是维持友谊关系。
但妻子的背叛还是让霍金的感到受伤，此时，朝夕相处的护士伊莲·梅森却成为他新的慰藉，霍金要伊莲尽可能陪伴他。而伊莲的个性强硬，对于霍金，大有想要自己独占，不让他家人接触的样子，这让他的家人非常反感。
苦苦维持的“和美家庭”最后终于走到尽头，1990年，霍金和妻子怀尔德正式离婚。
外界对于两人分道扬镳的原因众说纷纭，除了是情感因素，也有人在自己的著作中猜测他们离婚与霍金的科学研究有关。
我们都知道，霍金在对宇宙的研究中，有了自己的感悟，对于浩瀚宇宙的未知探索，可以得出神祗是不存在的，信仰来自于科学而非上帝，他是无神论者，他以自己的无边界理论完全排除了上帝的存在。
这对妻子怀尔德来说，却非常严重，是一种精神上的背叛，最初和霍金在一起，正是受到上帝的感召来执行自己的任务，作为一名虔诚的教徒，无法忍受最亲近的丈夫否定了自己的信仰和精神支柱。再加上霍金和护士伊莲暧昧的关系，种种原因纠结在一起，注定了两个人走不到最后的结局。
一别两宽，各自欢喜。霍金在1995年和护士伊莲结婚，他开心地说：“好棒，我与我爱的人结婚”。
简也和心上人琼斯结婚，并在1999年发表了一本回忆录《移动星星的音乐》，描述她与霍金婚姻的生活点滴与破裂之缘由，其曲折情节立即在大众传媒引起了一阵轰动。对此，霍金表现出一贯的淡然，不作回应。
再婚后的霍金，被护士伊莲限制了和子女见面的自由，子女怀疑，起居不便的霍金会受到继母的虐待。果不其然，2004年初，媒体报导霍金遭到伊莲的虐待，全世界都被震惊了。
不过霍金这次倒是没有沉默，在医院病床上发表声明，指称这消息失实，并表示“我全心坚决驳斥说我遭到虐待的说法。媒体的报导纯属虚构，有人散播这样不实的消息，令我感到失望。……我妻子与我相爱。今天我还能活着，完全是因为她。我要求媒体尊重我的私生活，让我专注于从疾病中恢复健康。”
但外界似乎对本人的回应不十分相信，至少有3名给霍金做过护工的女子指称，霍金的第二任夫人伊莲性格跋扈，甚至虐待丈夫。其中一人说，她曾看见伊莲殴打霍金；另一个说，她曾听见霍金被放进滚烫的水里洗澡时发出的痛苦叫声；第三名护工则说，霍金害怕单独和妻子在一起，并称后者曾经骂他是“傻瓜”、“笨蛋”。
2000年，霍金的朋友就曾发现他身上有多处神秘外伤，包括手臂手腕折断、脸部被割伤等，怀疑他遭受虐待。令人不解的是，霍金对虐待之事从来不肯透露半点儿口风，而且还与夫人伊莲一样，威胁身边人不准向警方吐露实情。
2004年1月，剑桥郡警方对霍金受虐一事进行调查。
但是，霍金拒不配合，调查无法进行下去。对此，霍金的子女们认为，霍金是个绝顶聪明的人，他肯定有“难言之隐”。
2007年，霍金和伊莲离婚。
而那本在前妻的照顾下写就的风靡全球的《时间简史》带来可观版税，也成为第二段婚姻的争夺焦点。
研究宇宙论和黑洞的天才，一脚踩进了婚姻的黑洞里。
霍金结束第二段婚姻后，前妻简再次走进他的生活。
只是，曾经相亲相爱终分道扬镳的夫妻，如今变成了相惺相惜握手言和的老友。
霍金居住的剑桥距离简只有十分钟的路程，她常去看望他，讨论孩子们，也聊些家庭事。在不管是影片《万物理论》的发布会，还是纪录片《霍金传》中，慈眉善目的简，都大方出镜，言辞恳切。
她说，他们在一起的日子，曾并肩努力，对抗困难，养育三个孩子。他们虽然分开，却从不曾失联。
霍金的两段婚姻，虽然都以离婚告终，但总算是收获过感情。
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