如果从培养人才的角度上说，清代教会学校的成就很有限——当然这也是因为面向中国人开办的教会学校直至1900年前后才出现，其影响大多是在民国年间才有所体现。
不过教会学校还是在清末培养了一批接受西方现代文化的学生，算是真正开国民西学之先，而这些学生也最终成为第一批摆脱传统礼教束缚、富有现代人精神的中国百姓——尽管这些人在群体性地愚昧和旧文人体系面前可以说是微不足道的。
清代的教会教育最大的功绩在于正式地将现代教育体系和方法引入中国，特别是清代的教会大学是中国近现代高等教育的基石。
追问还有消极影响吧？
追答消极影响很难说，毕竟就当时而言，中国的教育理念和教育内容是落后于世界的。
教会学校虽然由于是庙产，强制学生信仰和学习宗教，对于中国文化有一定的冲击，但是这种冲击也伴随着现代公民教育，很难说是一种偏消极的影响。