医院一般是公益性的，所以有一定扶持优惠，但会以是否营利加以区分：
一、相同部分：
1、对其自产自用的制剂免征增值税；
2、需要代扣代缴个人所得税；
3、各类应税合同、凭证，权利许可证照等应当缴纳印花税。
二、区别部分
（一）非营利性医疗机构
1、按照国家规定的价格取得的医疗服务收入，免征各项税收。
2、自用的房产、土地、车船，免征房产税、城镇土地使用税和车船使用税。
2、从事非医疗服务取得的收入，如租赁收入、财产转让收入、培训收入、对外投资收入等应按规定征收各项税收。非营利性医疗机构将取得的非医疗服务收入，直接用于改善医疗卫生服务条件的部分，经税务部门审核批准可抵扣其应纳税所得额，就其余额征收企业所得税。
（二）营利性医院
1、对其取得的医疗服务收入免征营业税；
2、其取得执业登记之日起，3年内给予下列优惠：土地、车船免征房产税、城镇土地使用税和车船使用税。3年免税期满后恢复征税（3年免税期满后恢复征税）；
3、需要缴纳企业所得税；
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