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一是工作性质方面，公务员从事的主要是国家行政事务性工作；事业单位人员从事的主要是社会公益性工作，或者说是非营利性的工作。
二是工资收入方面，公务员的工资收入是按照《国家公务员管理条例》的规定发放，并根据国家财政状况进行调资；事业单位人员的工资收入则根据财政拨款的不同性质有很大差别，分为全额拨款单位，部分金额拨款单位，市场化方式运作单位等，根据各地、各单位的不同经济状况，有很大不同。
三是保险福利方面，公务员享受的保险福利是按照《国家公务员管理条例》的规定执行；事业单位人员享受的保险福利是按照国家有关的社会保障规定执行，相对于公务员来说，有着更大的灵活性，根据各地、各单位的不同经济状况，有很大不同。
四是用人方面，公务员的录用、提升、退休、辞退、辞职等是按照《国家公务员管理条例》的规定执行；而事业单位人员的录用、提升、退休、辞退等是按照国家劳动法的有关规定执行。但事业单位对人员的管理权限要大一些。
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