循证医学研究是国际公认的评价药物疗效与安全性的科学方法，其主要特点是采用大范围、多样本、双盲实验来检验药物疗效。大范围，就是收入大量患者，然后分为用药组和对照组，用药组使用同一种药物治疗，对照组采用另一种药物治疗，最后比较两种药物的疗效。多样本，尽管患者所患的疾病相同，但各人的自身条件不同，如年龄不同，体质不同，只有多样本才能保证所研究的药物适用于大部分人群；双盲实验，就是医生与患者都不知道使用的是哪种药物，最后按编号统计使用药物后的疗效，这样最大程度地保证了药物疗效的客观性，得出真正值得患者信赖的用药依据。
从上世纪90年代开始，循证医学就在西方医学界形成了共识。如今，我国中医界也形成了共识：中医药要发展提高，走向世界与国际接轨，就必须遵循科学研究的国际规则。循证医学可以让中医的辨证论治更加系统化、规范化，使中医诊疗手段的有效性和安全性的评价国际化、科学化和标准化，最终使中医的成果为国际医学界所接受和认可。让世界了解中医药，认识中医药，使用中医药，循证研究是必由之路。
2009年，以首都医科大学附属北京佑安医院为组长单位，启动了“连花清瘟胶囊治疗甲型H1N1流行性感冒”的循证医学研究，联合河南省传染病医院、湖南省疾病预防控制中心，沈阳市、成都市、济南市传染病医院等国内九家甲型流感收治医院，在全国范围内收集了大量病例，病例涵盖了各主要发病年龄段、各种症状的甲型H1N1流感患者。这些流感患者分为试验组和对照组，试验组患者每天按照标准治疗量服用连花清瘟胶囊，另一组患者则服用对照药物奥司他韦胶囊。
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