珠晖区地方税务局机构设置详尽，分为内设行政科（室）、直属机构和派出机构三大板块。
内设行政科（室）：
办公室：主要负责政务管理、文秘工作、税收宣传、网站管理等，制定内部规章制度，并管理行政接待和后勤服务。
税政法规科：负责税政业务管理，执行税收政策法规，处理税务行政处罚和诉讼、复议，指导各类费（金）管理工作。
征管和科技发展科（发票管理科）：负责税收征管工作指导，实施征管质量检查，负责发票管理和税收信息化建设。
收入规划核算科：负责税收计划编制、税款管理、收入分析和重点税源监控，承担税收数据综合管理工作。
财务管理科：负责税务经费、资产管理和机关财务管理，编制财务预算，办理经费拨付和采购。
人事教育科：负责人事管理、思想政治工作、教育培训和党群离退休人员管理。
监察审计室：负责纪律检查、行政监察和内部审计工作。
直属机构：
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办税服务中心：负责税收政策宣传、税务登记、发票发售、纳税申报等服务，以及税收征收入库和减免税审批等工作。
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稽查局：负责税收专项检查、违法案件查处、配合打击税务违法案件。
派出机构：
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税务分局：覆盖全区11个乡镇、街道，管理5600余家各类企业的地方税收征收。
这些机构分工明确，共同确保珠晖区地方税收的规范、高效运作。