偏头痛的原因并不是十分明确，有关研究表明，偏头痛的原因可能跟以下几点有关。
第一点，是跟遗传因素有关，临床上接近50%-60%的患者都有家族的遗传史。
第二点，是跟机体的内分泌调节有关，临床上经常会见到患者在月经期或者内分泌紊乱，或者青春期以及妊娠期，还有绝经期出现头痛。
第三点，是跟患者的饮食有关，比如经常会引起头痛的一些食品，主要是巧克力、硝酸盐类的腌制食品，还有味精，还有红酒。
第四点，还有一些药物，比如一些避孕药也会引起偏头痛的发生。
第五点，还有一类是精神心理因素，过度的紧张、焦虑都会引起偏头痛的发生。偏头痛是临床常见的慢性神经血管性头痛综合征，其具体病因及发病机制目前尚不明确，可能与下列因素相关：
内因：首先是遗传因素，偏头痛具有遗传易感性，约60%的偏头痛患者具有家族史，其亲属出现偏头痛的风险是一般人群的3-6倍。此外，与神经系统兴奋性相关的基因突变与偏头痛的常见类型有关，提示偏头痛与大脑神经细胞的兴奋性紊乱相关。本病女性多于男性，多在青春期发病，月经期容易发作，妊娠或绝经后发作次数减少或停止，这提示内分泌和代谢因素参与偏头痛的发病。
外因：环境因素也参与偏头痛的发作。偏头痛发作可由某些食物或药物诱发。食物包括含酪胺的奶酪、含亚硝酸盐的肉类和腌制食品、含苯乙胺的巧克力、含谷氨酸钠的食品添加剂及葡萄酒等；药物包括口服避孕药和血管扩张剂如硝酸甘油等。另外，强光、过劳、应激及应激后的放松、睡眠过度或过少、禁食、紧张、情绪不稳等也是偏头痛的诱发因素。 综上所诉，偏头痛发病的原因复杂多样，涉及患者自身因素及周围环境因素，偏头痛患者除进行正规药物治疗外应尽量避免上诉发作诱因，减少头痛发作。
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