主要是土壤污染、土质下降，作物生长抑制等。
除草剂有一定的副作用，在使用过程中会产生很多危害，一般来说，除草剂对植物、病原体、土壤微生物及环境等都有一定的影响。而且它不止会造成环境污染，也会间接对人体造成伤害。
土地污染：农田喷施除草剂后，不被杂草吸收的的除草剂成分会游离存在于土壤中。目前，使用的化学除草剂有多数是长残留型，它们在土壤中的残留期一般可达36个月以上。根据调查，目前生产中普遍使用的除草剂中有20%~70%会长期残留于土壤中，从而使土壤、地下水、粮食受到污染。
不利于农作物生产：农作物会吸收并积蓄除草剂，其生物组织会遭到一定程度的破坏，无法合成其应具备的某些营养元素，从而导致作物果实中的某些营养成分缺失。除草剂在正常用量情况下，对小麦、玉米、大豆、棉花等作物都有一定的抑制作用，若使用不合理，影响农作物正常发育和成熟，导致隐性减产。湖南省研究试验表明，除草剂副作用可导致水稻、小麦、大豆、玉米减产10.5%~26.8%。 任何除草剂在土壤中都有一定的残留期，有的甚至长达3~5年，在除草剂残留量大时，后茬种植敏感作物时易产生药害，植株无法正常生长，严重的导致绝收。比如辣椒新生叶不能正常展开，雏缩伸长，叶缘扭曲，果类严重畸形，形似“多胞胎”，无商品价值。
土质下降，土地“癌化”就是人们所说的“癌症田”，无法改茬，目标作物产量低或根本没有收成。在我国的东北地区，黑龙江、吉林等地，因长期过量使用除草剂，已出现大面积的“癌症田”。
而且它不止会造成环境污染，也会间接对人体造成伤害。动物食用除草剂污染的饲料，侵害其肝、肾、消化器官，造成食欲下降，造血功能受损，逐渐消瘦，衰竭而亡。据来自贵州省的报道，除草剂残留中毒造成一牧业发展有限公司42 只怀孕母羊流产，33只患羊死亡。这些现象在牧区表现比较突出。人类食用受除草剂残留染污的食品，对健康造成严重的影响，可以造成脱发、白血病、肿瘤、肾坏死、股骨头坏死、孕妇易流产等多种疾病。如越南曾因战争原因，其大面积国土被喷洒8 000 万L 橙剂高效除草剂。多年后，仍有约 300 万越南人遭受此除草剂残留引发的癌症、基因变异、女性不孕等疾病的折磨。
参考资料
农田喷施除草剂后，不被杂草吸收的的除草剂成分会游离存在于土壤中。农作物就会吸收并积蓄除草剂，其生物组织会遭到一定程度的破坏，无法合成其应具备的某些营养元素，从而导致作物果实中的某些营养成分缺失。
除草剂在正常用量情况下，对小麦、玉米、大豆、棉花等作物都有一定的抑制作用，若使用不合理，影响农作物正常发育和成熟，导致隐性减产。湖南省研究试验表明，除草剂副作用可导致水稻、小麦、大豆、玉米减产10.5%~26.8%。
任何除草剂在土壤中都有一定的残留期，有的甚至长达3~5年，在除草剂残留量大时，后茬种植敏感作物时易产生药害，植株无法正常生长，严重的导致绝收。比如辣椒新生叶不能正常展开，雏缩伸长，叶缘扭曲，果类严重畸形，形似“多胞胎”，无商品价值。
目前，使用的化学除草剂有多数是长残留型，它们在土壤中的残留期一般可达36个月以上。根据调查，目前生产中普遍使用的除草剂中有20%~70%会长期残留于土壤中，从而使土壤、地下水、粮食受到污染。
土地“癌化”就是人们所说的“癌症田”，无法改茬，目标作物产量低或根本没有收成。在我国的东北地区，黑龙江、吉林等地，因长期过量使用除草剂，已出现大面积的“癌症田”。
美国《纽约时报》报道，美国农民过度使用孟山都公司生产的农达除草剂，导致抗除草剂杂草迅速滋生。为防治这些超级杂草，农民被迫喷洒毒性更强的除草剂。
动物食用除草剂污染的饲料，侵害其肝、肾、消化器官，造成食欲下降，造血功能受损，逐渐消瘦，衰竭而亡。据来自贵州省的报道，除草剂残留中毒造成一牧业发展有限公司42 只怀孕母羊流产，33只患羊死亡。这些现象在牧区表现比较突出。
人类食用受除草剂残留染污的食品，对健康造成严重的影响，可以造成脱发、白血病、肿瘤、肾坏死、股骨头坏死、孕妇易流产等多种疾病。如越南曾因战争原因，其大面积国土被喷洒8 000 万L 橙剂高效除草剂。多年后，仍有约 300 万越南人遭受此除草剂残留引发的癌症、基因变异、女性不孕等疾病的折磨。本回答被网友采纳
除草剂造成的药害症状具有多变性和多样性，与某些病害症状类似，在诊断上往往造成认识错误。一般药害较病害症状表现快，无病原物出现。在生产上应加强对除草剂药害的识别。 （一）苯氧羧酸类：常用药剂有2，4-滴、二甲四氯、2，4-滴丁酯等。 症状为叶、花、穗畸形。叶片厚、浓绿，卷曲，鸡爪状或葱管状；茎脆，易断，茎基肿大；根短粗，无根毛，植株矮小；严重时停止生长，皮层开裂，落花、落果，最后死亡。 （二）芳氧苯氧丙酸类：常用药剂有稳杀得、禾草克、盖草能、威霸、骠马等。 症状主要为植株畸形，生长点变黄褐色，心叶紫或黄色。 （三）二苯醚类：常用药剂有草枯醚、杂草焚、虎威等。 症状为叶片产生褐色坏死斑，严重时叶畸形，枯焦，无新叶。 （四）酰胺类：常用药剂有拉索、都尔、敌稗、丁草胺等。 症状为轻时叶黄，重时叶出现斑点，卷曲皱缩，最后枯死。 （五）氨基甲酸酯类：常用药剂有杀草丹，灭草猛、燕麦畏等。 症状为叶卷曲，分蘖多，茎基、新根粗短，植株矮小。 （六）取代脲类、三氯苯类：主要有绿麦隆、扑草净、西玛津等。 主要为缺绿症，心叶和叶尖开始，发黄似火烧，植株矮，生长慢。 （七）杂环类：主要有百草枯、草甘膦、豆科威、恶草灵、苯达松等。 症状为叶变色，枯黄，最后植株枯死。
药害的防止：
为了防止除草剂使用不当而产生药害，必须严格按照使用技术，规范操作。 （一）注意除草剂与敏感作物。不同的作物对不同的除草剂敏感程度不一致。防除阔叶类杂草的除草剂对禾本科作物敏感，而阔叶类作物对防除禾本科杂草的除草剂敏感。如2， 4-滴、二甲四氯对棉花、瓜类、豆类、果树等敏感；盖草能、稳杀得等对小麦、水稻、玉米敏感。因此在使用时，要看好说明书，认清除草剂的特点与性能，注意敏感作物，谨防误用或药剂漂移。 （二）注意作物敏感时期。在正常情况下，作物在发芽、三叶前及扬花灌浆期对除草剂特别敏感，容易产生药害。 （三）严格掌握除草剂用量和浓度。为防止除草剂用量和浓度过高造成局部药害，在使用除草剂时，药液要均匀喷洒，行走速度、手动控制喷幅的宽窄、快慢也要均匀，工作时间不易过长。 （四）掌握除草剂使用技术操作要点： 1、“一平”：地要平。施药田块要精细耕作，保证地面平整，无大土块，无坑坑洼洼。 2、“二匀”：药在载体上要混均匀，喷雾或撒毒土要均匀。 3、“三准”：施药时间准、施药量准、施药地块面积准。如40%燕麦畏防治野燕麦，于播种前，3千克/公顷用药。 4、“四看”：看苗情、草情、天气、土质。对未扎根或瘦弱苗不易施药：根据杂草的种类及生长情况用药；气温较低时施药量在用药的上限；粘重土壤用药量高些，沙质土壤用药量少些；土壤干燥不用药。 5、“五不”：苗弱苗倒不施药；水田水浅不足3厘米或水深淹过心叶不施药；田土太干不施药；大雨时或叶上有露水时不施药；稻田漏水田不施药。 （五）掌握药剂性能。掌握药剂是否易挥发、光解，在土壤中是否易发生物理或化学反应。 （六）明确“主攻部位”。一般土壤处理的除草剂“主攻部位”是杂草刚萌发、幼嫩茎叶等部位，即3叶前。而磺草灵在杂草盛期作茎叶处理，由茎叶吸收后再传导到其它组织。 （七）用药时间合理。如敌稗在2叶期，丁草胺在播前2-3天，克无踪、草甘磷随杂草叶面积增加而提高效果。 （八）发挥水的作用。西草净、果尔、禾大壮、农得时等施药后保持水层4-6厘米，可发挥药效，不产生药害；而杀草丹、除草醚在田块积水时易产生药害。 （九）禁止乱混乱用。除草剂混用可提高药效，扩大杀草谱，但盲目混用，易造成药害。如敌稗不能和有机磷类或氨基甲酸酯类混用；二甲四氯不能和酸性农药混用等。 （十）清洗喷雾机具。用过除草剂的喷雾机要清洗干净，可先用清水冲洗，再用肥皂水或2-3%碱水反复洗数次，最后再用清水冲洗。[1]
药害的克服：
一旦使用除草剂产生药害，应积极采取有效措施进行补救，把可能造成的损失降到最低。 （一）排毒。⑴当用药最大时，应立即排掉田间灌溉水，数次用新水冲灌，并施入石灰等中和酸性除草剂。⑵若植株上除草剂多时，可用喷灌机械水淋洗，减少粘在叶上的毒物。⑶当田块局部发生药害时，先放水冲洗、耕耘，后补苗，再增施速效化肥。⑷若田块中毒严重，地块应暴晒，淋洗后深翻，无影响后再种植，否则再冲灌。或栽种少量敏感作物，观察10-15天。 （二）加强田间管理。药害轻时，及时打顶或摘除受害部分，增施速效肥，并合理灌溉；严重时，翻耕土地，补种或改种；对禾本科发现筒状叶时，可多施分蘖肥和有机质肥，还可用稀氨水或1%石灰水喷施，并喷激素农药。 （三）应用植物生长调节剂。喷施4%赤霉素乳油，促进作物生长。 （四）应用安全剂。安全剂又称解毒剂，可保护作物，对多种除草剂能够解毒。如用活性炭包覆种子或蘸根、蘸茎，或均匀撒于土表，可防西玛津对大豆、小麦产生药害；荼二甲酐可防止丙草丹等硫化氨基甲酸酯类对玉米的药害。