南宁糖业为实现内部资源的优化配置，提高经济增长的质量，进行了一系列结构调整，实现集约化生产，公司先后对下属的明阳糖厂、香山糖厂、伶俐糖厂进行扩建；关停原下属的蒲庙糖厂，分二期建设年产6.8万吨漂白蔗渣浆项目工程，控股南蒲纸业有限责任公司，并使其产能扩大40%；利用配股募集资金与外商合作建设的年产1万吨SAP新型吸水材料项目，对华侨投资区侨凤卫生制品公司进行重组；建设年产5.1万吨涂布白纸板生产线，年产1.5万高级文化用纸生产线和年产2万吨生活用纸生产线。
南宁糖业在结构调整过程中坚持发展与治污并重，走可持续发展道路，公司的生产形成了甘蔗——制糖——废糖蜜制酒精——酒精废液制复合肥（或酒精废液浓缩燃烧——钾灰制复合肥）和甘蔗——制糖——蔗渣——制浆——造纸两条生态链，形成资源——产品——再生资源的循环经济生产模式，通过全面的综合利用，基本实现了循环经济产业链。
2008年，南宁糖业投资3.5亿人民币对下属的东江糖厂进行日榨甘蔗6000吨技改扩建；完成了对下属的南宁天然纸业有限责任公司（子公司）第三期扩产技改工程的建设；成立了南宁糖业股份有限公司第一纸业分公司。公司下属的四家糖厂通过了ISO22000食品安全管理体系认证。2008年尽管受金融危机的影响，南宁糖业（含所属控股子公司）销售收入仍然突破33亿元，其中股份公司销售收入27亿元。
作为国内制糖生产的知名企业，南宁糖业以一系列的内部结构调整和资本运营，实现了资源的优化配置与集约化经营，企业内部形成了循环经济生产格局，扩大了综合利用的深度和广度，增强了企业实力，扩大了企业规模。公司将进一步贯彻落实科学发展观，通过强化内部管理，依靠技术进步促进企业的科学发展，力争把南宁糖业打造成以蔗糖生产为主，多元化发展的跨行业、跨地域的现代化企业集团，实现企业与社会的和谐发展。
