南京自由行攻略推荐为：Day1：总统府→南京博物院→颐和路→天空之都、Day2：钟山风景区→夫子庙＆秦淮河→老门东、Day3：古鸡鸣寺→大报恩寺。
Day1：总统府→南京博物院→颐和路→天空之都。
总统府：可以感受南京风情、了解中国近代史。需在gzh提前预约，最晚下午四点前检票进场；南京博物院：需要提前在微信预约，开放时间为9：00—17：00。有六大馆，民国馆尤其适合汉服、旗袍拍照。
一条颐和路，半部明国史，黄色外墙的民国老建筑和道路两旁高大的梧桐树相印相衬，是历史和深秋最美好的结合；天空之都：南京的网红天台，有“我爱南京”的标志和吧台和挂同心锁的网。晚上风大建议带件外套。
Day2：钟山风景区→夫子庙＆秦淮河→老门东。
钟山风景区（网上买套票比较划算）；夫子庙：太适合逛一逛拍拍照了，放松又愉悦；古秦淮：逛完夫子庙就去旁边的古秦淮，秦淮夜景一绝，出片神地；老门东：老门东就在古秦淮隔壁，里面有很多小吃，体验感超级好！
Day3：古鸡鸣寺→大报恩寺。
鸡鸣寺：祈福要在中午12点之前去；大报恩寺：跟传统的寺庙不一样，大报恩寺既保留了传统的寺庙形式，又加入了现代化科技，很新颖。
南京其他景点推荐：
1、栖霞山
栖霞山素有“六朝胜迹”之称，在明代被列为“金陵四十八景”之一，有“一座栖霞山，半部金陵史”的美誉。历史上曾有五王十四帝登临栖霞山，历史古迹遗址80多处，荟萃了宗教文化、帝王文化、绿色文化、名人明俗文化、地质文化、石刻文化、茶文化。
2、清凉山
清凉山位于清凉门内，是南京城西的丘陵山冈，山势椭圆，蜿蜒伸展于汉中门至定淮门一带。清凉山古名石头山、石首山、石头城，有“六朝胜迹”之称，诸葛亮曾称金陵形势为“虎踞龙蟠”，虎踞就指今清凉山。
3、南京牛首山
牛首山又名天阙山，是金陵四大名胜之一，因山顶东西双峰形似牛头双角而得名。一座牛首山，半部南京史。牛首山风光秀美，素有“春牛首”之美誉，古有牛首烟岚、献花清兴、祖堂振锡等金陵美景，还遗存了很多历史古迹，如岳飞抗金故垒、摩崖石刻、弘觉寺塔、郑和文化园等。
以上内容参考：百度百科-南京市