套牌车能被查出来。
智能卡口系统：
套牌车会被交警查出来，肉眼难以区别的套牌车可以通过智能卡口系统来甄别。智能卡口是智能化交通指挥中心的一个重要运用系统，系统具有数据统计、信息比对、报警拦截等功能。该系统首先可以根据需要统计车流量、行程车速等交通参数，用于道路通行状况的分析。
法律规定：
《中华人民共和国道路交通安全法》第九十六条规定，伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、驾驶证的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处十五日以下拘留，并处二千元以上五千元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。