电瓶车充电时充电器一闪一闪的是因为：
1、电池充电器里的电压低。假如电池充电器内原有零部件的焊点接触不好，就会使电池充电器内的电压低，造成充电不够。电池充电器的指示灯便会一闪一闪的。这样的情况下，一般建议进行更换电池充电器。新换的电池充电器只要和电瓶车相符合就行了。
2、电瓶车的电池老化了。电瓶车电池的充放电次数是有限的，假如超过了电池的使用期，就会出现电池老化现象。假如电瓶车的电池老化，电动车在充电时，电池充电器的指示灯便会忽闪忽闪的。这时候，可以考虑进行更换充电电池。
3、还有一种可能，就是充电器接口松动。假如充电器接口出现松动，就没办法通过电源给电瓶充电。因此，电池充电器的指示灯会一闪一闪的。假如出现这样的情况，也可以先检查电动车的充电插口。尝试重连，这个问题通常就可以解决了。
因此，一般来说，电瓶车充电时，假如充电器指示灯出现一闪一闪的情况，可以依次检查以上的问题。只需妥善处理，就不会对电瓶车造成严重损坏。