赵墩镇位于温带半湿润季风气候区，春季气候较为干燥，春季特色明显。夏季受海洋季风影响显著，气候炎热潮湿，降雨丰富。秋季则空气清新，气候宜人。冬季则受偏北风影响，气候寒冷，降水稀少。总体而言，赵墩镇的气候温和湿润，四季分明，有利于农作物的生长。年均气温为13.5摄氏度，年降水量大约为940毫米，年日照时数平均2350小时。冬季受西北风主导，多干冷，夏季则是东南风为主，湿热多雨。常年主导风向为东北风。
地形方面，赵墩镇地势平坦，土壤类型为黄潮土，适合种植各类农作物。海拔高度约23.0米，地处高田平原区，土壤主要呈棕色。地震烈度等级为9度。境内水系丰富，京航运河穿越镇东北，彭河、不老河、房亭河和抽淤河等河流交织，为镇区提供了丰富的水资源。
交通条件方面，赵墩镇拥有便利的对外交通。徐海一级公路贯穿镇区，南北方向上，向西可达徐州市，向东则通向邳州市区。此外，镇东北的京航运河为赵墩镇的水路交通提供了良好的条件，进一步提升了其交通便利性。
江苏省邳州市赵墩镇位于中国拥军模范城市——徐州市东50KM的徐连一级路上，这里东临京沪高速公路，南靠观音机场和霍连高速公路，京杭大运河、东陇海铁路、徐连一级路、邳睢一级路穿境而过。优越的交通地理环境，蕴育了经济和社会事业发展的巨大潜能。随着改革开放的鼓点，赵墩镇在迈向文明、富裕的征程中，愈显出她的勃勃生机、欣欣向荣。