权证和股票期权的基本差别在于：
1、标准化程度不同，个股期权是由交易所设计的标准化合约；权证是非标准化合约，由发行人自行设计合约要素，除由上市公司、证券公司或大股东等主体单独发行外，还可以与可分离交易可转债一起发行。
2、发行主体不同，个股期权没有发行人，合约条款由交易所设计，市场参与者在支付足够保证金的前提下都可以开仓卖出期权；权证则必须有特定发行主体，主要是上市公司、证券公司或大股东等第三方。
3、有效期，权证的有效期一般是在一年以上，而股票期权的有效期一般是在一年以内。
4、卖空，权证的交易通畅不允许卖空，而股票期权在交易中，投资者可以自由卖空。
5.第三方结算，在权证的结算是在发行人和持有人之间进行，而股票期权的结算，是由独立买卖双方的专业结算机构进行结算。
6.做市商，权证的做市义务通常有发行人自行承担，而股票期权的做市商必须是经过交易所正式授权。