准确说，玉皇大帝和女娲娘娘两者之间由于时代差异，并未多大关系，但都属于中国神话传说中的重要神祇。
（一）女娲娘娘
女娲的地位和身份，注定了她是玉皇大帝的老前辈，她属于创世神灵。主要事迹记载于先前时期的《山海经》以及《淮南子》等古籍之中。
比如，在《山海经》中就提到了所谓的“女娲之肠”，郭璞注：“女娲，古神女而帝者，人面蛇身，一日中七十变。”
《大荒西经》“有神十人，名曰女娲之肠，化为神，处栗广之野。横道而处。”
而到了《淮南子·览冥训》中，就详细记述了女娲补天救世的全过程，显得极为惊心动魄。
往古之时，四极废，九州裂，天不兼覆，地不周载；火滥炎而不灭，水浩洋而不息，猛兽食颛民，鸷鸟攫老弱。于是,女娲炼五色石以补苍天，断鳌足以立四极，杀黑龙以济冀州，积芦灰以止淫水。苍天补，四极正；淫水涸，冀州平；狡虫死，颛民生。”
“俗说天地开辟，未有人民，女娲抟黄土作人，剧务力不暇供，乃引绳于泥中，举以为人。故富贵者黄土人也，贫贱凡庸者縆人也。”
（二）玉皇大帝
玉皇大帝，是道教范畴中仅屈居于三清之下的众神之皇。 至于“玉皇大帝”这一名号的由来，《玉帝圣号同异考》曾解释道：“玉帝圣号，崇自牿劫前，中古复尊上……敬上诸神之号，以定称谓。”
至于玉帝的来历，一般有两种说法。第一种说法，认为玉皇大帝是光严妙乐国的太子渡劫而成。根据《高上玉皇本行集经》的内容，很久之前，有一光严妙乐国，因国王和王后长久未生育子嗣，便命道士做法祈祷。之后，王后梦到太上老君将一个婴儿赐给了自己，梦醒即有了身孕。怀胎一年后，王后生下一子，命为太子。
太子长大继位后不久，便离开国都前往普明香严山修道。之后，他功成超度，历经三千劫难，始证金仙，后历经亿劫，始证玉帝。
所以，综合玉帝和女娲的情况来看，如果非要说二者有关系的话，也只能是前辈和晚辈的关系了。
玉皇大帝的原型昊天上帝和女娲一样，都是先秦古典神话中的“创世神”。明代神魔小说封神演义，可谓是我国文学界一部不可多得的杰作。书中以各种宗教典故，民间传说中的神灵为原型，讲述了一场轰轰烈烈的“封神之战”。
在这部小说中，纣王亵渎女娲，后者本来想直接强行灭掉商纣，却被昊天上帝以“不可败坏天道气运”为由阻拦。当然，这只是小说家言而已，在我国的正宗神话中，女娲和玉皇大帝（昊天上帝）到底是什么关系呢？
所谓的“玉皇大帝”，他的全称就是“昊天金阙自然无上妙有天皇大帝”，因此，他实际上就是以传统神话中的“昊天上帝”为原型。昊天上帝是历朝历代官方祭祀的“先天正神”，也是儒教中的至高主宰，代表皇权。宋真宗曾经就自称过“玉帝之子”。昊天信仰可谓是由来已久了，早在先民部族时代，人们就已经开始崇拜上天，信仰上天，昊天，就是“天”的人格化。在《尚书》，《诗经》中都有着他类似的记载，也叫“太一”。太一开天辟地，造就万物，才有了世界。
而女娲娘娘，一样也是先秦典籍中屡屡登场的远古神灵，“先民崇拜”之一。据目前的考古资料显示，女娲的出现，和昊天，炎黄二帝的信仰处于同一个时代。目前最早记载女娲的典籍，就是《楚帛书》。女娲和昊天的共同点就在于，他们都是传统神话中的“创世神”。《楚帛书》，就讲述过女娲娘娘开天辟地的典故。
很多人可能会对此产生疑惑：开天辟地的大神不是盘古吗？实际上，盘古信仰的出现时间远远比昊天和女娲晚的多，学术界认为是在三国时期。在东汉末年的《三五历纪》中，才有了盘古的故事。