1.对活细胞和组织或细胞组织切片进行连续断层扫描，能获得精细的单个细胞或一群细胞或所观察的局部组织的各个层面结构（包括细胞特异结构－如
细胞骨架、染色体、
细胞器和细胞膜系统，样品的深层结构）和完整的3D图像；
2. 细胞内离子荧光标记，单标记、双标记或三标记，甚更高多重标记，检测细胞内如pH和钠、钾、钙、镁等离子浓度的比率测定及其动态变化；
3.荧光标记探针标记的活细胞或切片标本的细胞生物物质，膜标记、细胞示踪、免疫物质、免疫反应、受体或配体，
核酸等观察；可以在同一张样品上进行同时多重物质标记，同时观察；
4.荧光检测快、激发
光强度精确控制、光漂白和荧光淬灭作用小；
5.对细胞检测无损伤、精确、准确、可靠和优良重复性；数据图象可及时输出或长期储存。