云浮校区
广东药科大学云浮校区位于云浮市云浮新区，占地2300亩，校区建筑总规模为36.56万平方米。云浮校区紧密结合国家、广东省和云浮市战略发展需求，主要围绕区域医疗服务、医药制造、中药种植、健康养老、中医养生、文化休闲旅游等大健康产业，突出中医药特色，凸显南药资源优势，开展高水平人才培养、科学研究、产业开发、技术转化，为支撑国家、广东省、云浮市健康产业发展提供人才、技术和智力保障。2018年秋季开始招生办学，现有中医学院、中药资源学院、护理学院、健康学院和医药信息工程学院共5个学院在校区办学。
中山校区
广东药科大学中山校区，座落在伟人孙中山故里中山市风景如画的五桂山风景区，自然环境得天独厚。校区占地面积2000亩，环境优美，功能齐备。学校紧密结合区域产业发展需求，在该校区重点发展医药化工、食品工程等学科，是学校培养医药相关专业人才的校区。校区设有食品科学学院、医药化工学院、医药商学院等，开设有药事管理、中药学、中药资源与开发、食品质量与安全、食品科学与工程、医药化工、医药贸易、医药信息工程等多个专业及专业方向。
广州校区赤岗校园
广东药科大学广州校区赤岗校园位于广州市海珠区赤岗江海大道中。校区占地面积80余亩，是以医学教育为主的校区。校区设有公共卫生学院、临床医学院、护理学院和健康学院等，开设有预防医学、卫生检验与检疫、临床医学、中医学、医学检验技术、护理学、康复治疗学、健康服务与管理等8个专业及专业方向。
广州校区宝岗校园
广东药科大学广州校区宝岗校园位于广州市海珠区。是学校承担成人学历教育和教育培训的校区。现有成人脱产、业余和函授本专科学历教育，开设药学、中药学、临床医学、护理学、预防医学等本专科专业与方向；此外，现还有江门、阳江、湛江、连州、梅州、佛山、珠海、广宁、东莞、黄埔、惠州、肇庆、吴川等多个校外教学点。校区还设有直属门诊部等。