这两所大学不是同一所大学。
香港中文大学 （深圳）（The Chinese University of Hong Kong
Shenzhen），简称港中大（深圳）（CUHK-Shenzhen），香港地区称“中大（深圳）”。大学以书院制大学建制，系中外合作大学联盟成员，国际商学院协会（AACSB）认证成员。
香港中文大学（The Chinese University of Hong Kong），简称港中大（CUHK），书院制大学建制，为世界大学联盟、环 太平洋大学 联盟、亚太国际教育协会、中国大学校长联谊会、英联邦大学协会成员，亚洲首家国际商学院协会（AACSB）认证成员，是一所以“中国研究”、“生物医学科学”、“信息科学”、“经济与金融”、“地球信息与地球科学”为五大重点研究领域的公立研究型综合大学，并在这些领域堪称世界级学术重镇。
一、学校性质不同
1、 香港中文大学 深圳校区：是一所经中华人民共和国教育部批准，按照《中外合作办学条例》设立，传承香港中文大学办学理念和学术体系的大学，为广东省高水平大学重点学科建设高校。
2、香港中文大学：是一所亚洲顶尖、享誉国际的公立研究型综合大学。
二、成立时间不同
1、香港中文大学深圳校区：2014年3月21日，国家教育部同意批准设立香港中文大学（深圳）。
2、香港中文大学：香港中文大学由新亚书院、崇基学院及联合书院于1963年合并而成。
三、院系专业不同
1、香港中文大学深圳校区：截至2018年5月，香港中文大学（深圳）设有经管学院、理工学院、人文社科学院、数据运筹院以及研究生院，并设有覆盖理学、工学、文学、社会科学、经济学和管理学，共计14个本科专业和11个研究生专业。
2、香港中文大学：根据2019年4月学校官网，学校设有8个学院：文学院、工商管理学院、教育学院、工程学院、法律学院、医学院、理学院和社会科学院，开设多个主修、副修和双学位学士课程。此外，学校还与北京大学、清华大学、日本 早稻田大学 等高校合办多个本科及硕士课程。
参考资料来源：百度百科-香港中文大学（深圳）
参考资料来源：百度百科-香港中文大学