民用航空器机长具有的权利有：
一、最高指挥权：
航空器所载人员中，最高指挥权只能归属一人，机上的一切活动都在他的统一领导下进行，这个人就是责任机长。基于保护民用航空器极其所载人员和财产安全的极端重要性，有关法律法规和行业规章都明确了机长的最高指挥权和领导权威，以便其履行对机上人员的管理，以及民用航空器的操作和应急处置等具体职责。
二、最终决定权：
根据有关规定，机长的最终决定权主要体现在以下几个方面：
1.起飞决定权
飞行前机长应对民用航空器实施必要的检查，未经检查不得起飞。机长发现民用航空器、机场、气象条件等不符合规定，不能保证飞行安全的，有权拒绝起飞。
2.航空器处置权
飞行中，遇到特殊情况时，为保证民用航空器及其所在人员的安全，机长有权对民用航空器做出处置。
3.机组人员决定权
机长发现机组人员不适宜执行飞行任务的，为保障飞行安全，有权作出调整。
三、治安管理权：
机长的职责包括对飞行中任何破坏民用航空器、扰乱民用航空器内秩序、危害民用航空器所载人员及财产安全以及其他危害飞行安全的行为，有权采取必要的适当措施。机长的治安管理权主要体现在以下几个方面：
1.犯罪或违法活动的控制权
机长有理由认为某人在航空器上已犯或者行将犯罪或危害航空安全的行为时，可对犯罪或违法嫌疑人采取合理措施，包括必要的管束措施，并可以要求或授权其他机组人员进行协助，甚至请求或授权旅客给予协助。
2.违法嫌疑人驱离权
对于危害或者能够危害航空器或其所在人员安全、或危害航空器上良好秩序的违法嫌疑人，机长有权在民用航空器降落的任何国家的领土上令此人离开航空器。
3.犯罪嫌疑人或其他行为人移交权
在飞行中的民用航空器内发生触犯登记国刑法的严重犯罪，不论其是否危害航空安全，机长有权将犯罪嫌疑人移交给民用航空器降落地任何缔约国的主管当局。
4.免除责任权
只要机长治安权的行使符合规定，就会被施以免责保护。被免责人员包括机长、其他机组成员、旅客、航空器所有人、航空器经营人、本次飞行租机人或包机人，被免除的责任包括民事责任、行政责任和刑事责任。机长的其他权力还包括受委托转递外交邮袋、以航行日志作为运行证明、以及在特定空域内作为公司代表办事等方面。
法律依据：
《中华人民共和国民用航空法》
第四十五条飞行前，机长应当对民用航空器实施必要的检查；未经检查，不得起飞。机长发现民用航空器、机场、气象条件等不符合规定，不能保证飞行安全的，有权拒绝起飞。
第四十六条飞行中，对于任何破坏民用航空器、扰乱民用航空器内秩序、危害民用航空器所载人员或者财产安全以及其他危及飞行安全的行为，在保证安全的前提下，机长有权采取必要的适当措施。飞行中，遇到特殊情况时，为保证民用航空器及其所载人员的安全，机长有权对民用航空器作出处置。
第四十七条机长发现机组人员不适宜执行飞行任务的，为保证飞行安全，有权提出调整。
第四十八条民用航空器遇险时，机长有权采取一切必要措施，并指挥机组人员和航空器上其他人员采取抢救措施。在必须撤离遇险民用航空器的紧急情况下，机长必须采取措施，首先组织旅客安全离开民用航空器；未经机长允许，机组人员不得擅自离开民用航空器；机长应当最后离开民用航空器。
第四十九条民用航空器发生事故，机长应当直接或者通过空中交通管制单位，如实将事故情况及时报告国务院民用航空主管部门。
第五十条机长收到船舶或者其他航空器的遇险信号，或者发现遇险的船舶、航空器及其人员，应当将遇险情况及时报告就近的空中交通管制单位并给予可能的合理的援助。
第五十一条飞行中，机长因故不能履行职务的，由仅次于机长职务的驾驶员代理机长；在下一个经停地起飞前，民用航空器所有人或者承租人应当指派新机长接任。
第五十二条只有一名驾驶员，不需配备其他空勤人员的民用航空器，本节对机长的规定，适用于该驾驶员。
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