有机水稻种植过程中不施用化学农药、化肥、生长调节剂，而在水稻栽培过程常受到稻瘟病、纹枯病、螟虫、稻飞虱、稻纵卷叶螟等病虫害的为害，从而影响有机水稻的产量及品质。因此，有机水稻如何防治病虫害？现将有机水稻病虫害防治措施总结如下：
1、稻瘟病防治适期：叶瘟发病初期，穗瘟在始穗、齐穗期。
防治措施：选用抗（耐）病品种；种子消毒，1%石灰水浸种，早稻浸 48小时，晚稻浸 24 小时；春播前处理室外堆放的有病稻草；健身栽培提高水稻抗（耐）病能力；1:3:300 波尔多液（不能防穗瘟）或 0.3 度石硫合剂或 2%茶枯饼浸出液兑水 50 公斤喷雾或枯草芽孢杆菌。
防治适期：分蘖末期病丛发率 5%，孕穗期病丛发率10%。
防治措施：春耕沤田，夏耕灭茬时，打捞浮于水面上的浮渣，深埋或烧毁，减少菌源；加强田间管理，适当密植，浅水勤灌，适时晒田，降低田间湿度；防治药剂井冈霉素、申嗪霉素等。
防治适期：水稻破口前 3-5天。
防治措施：选用抗（耐）病品种；种子消毒（同稻瘟病）；烧毁散落于晒场上的病粒；稻田深耕翻埋病菌于土层深处；防治药剂井冈霉素、申嗪霉素等。
防治适期：成虫高峰至卵盛孵期。
防治措施：及时拾毁冬种田外露禾蔸；各代螟虫蛹盛期灌深水灭蛹；简化栽培制度，避免单、双季稻混栽，切断桥梁田；调整栽插期，使水稻易受害生育期（孕穗期-抽穗期）与蚁螟盛卵期错开，减轻螟害；及时春耕沤田和夏耕灭茬消灭越冬代和二代螟虫；每亩设置性诱捕器 1 个诱杀螟蛾，每 30-50 亩设置 1 盏杀虫灯诱杀螟蛾；保护天敌；防治采用草石灰粉杀虫，烟草 2.5-5.0 公斤加石灰粉（草木灰粉）10-15 公斤撒施于稻田；防治药剂可选用苏云金杆菌、绿僵菌等。
防治适期：成虫高峰至卵盛孵期。
防治措施：及时夏耕灭茬，消灭部分 2 代螟蛹于羽化之前，减少下代发生基数；采用杀虫灯诱杀成虫，保护天敌；防治药剂可选用天然除虫菊、印楝素、苦参碱、鱼藤酮和苏云金杆菌。
防治适期：分蘖期百丛 500只、孕穗期百丛1000 只。
防治措施：选用抗（耐）虫品种；健身栽培，推广湿润灌溉、适时晒田，降低田间湿度；保护天敌和养鸭治虫；采用杀虫灯等诱杀长翅型成虫；植物油灭虫可选用乌桕油、樟树子油、桐油、茶油等植物油，每亩用 0.25-0.5 公斤，于晴天下午 1-3 时滴于稻田，然后用竹竿将虫扫落于水中，或拌粗沙 100 公斤撒施于稻田。
防治适期：浸种期。
防治措施：1%盐水或黄泥水选种；种子消毒（同稻瘟病）；禽畜粪肥充分腐熟后施用；带菌稻谷用作饲料，应做到蒸煮后喂饲，防止病菌经禽畜粪便传播。
防治适期：发病初期
防治措施：选用抗（耐）病品种；种子消毒，1%石灰水浸种 48 小时（早稻）或 24 小时（晚稻）；稻田不应串灌、漫灌、长期灌深水，防止病菌传播；草木灰粉和石灰粉按 1:1 比例混合，每亩用 15公斤于露水未干时撒施于稻叶上。
注意事项：种植有机水稻，防控病虫害用药要求严格使用生物源性农药，且各类药剂在水稻生长期内只允许使用一次，不得使用化学农药。