因为近亲结婚生的孩子很有可能会不健康，新生儿畸形，脑瘫的概率会比较大，如果家族有遗传病的话，新生儿患上遗传病的几率也会大大增加，所以到了现在就不允许近亲结婚了，而古代的时候封建观念比较重，再加上古代医疗卫生条件不是很好，所以新生儿夭折的几率比较大，所以也就看不来近亲结婚的弊端。
其实在古代的时候越是地位高的家庭越喜欢近亲结婚，因为古代在封建思想的作用下，他们觉得肥水不流外人田，自己家的人互相结婚，才能保留住自己家族的家产，不管后来谁做了家族继承人，反正都是他们自己人。在古代这样的思想并不是少数人，绝大多数人都是这种思想。
中国四大名著之一《红楼梦》中就是这样的，林黛玉其实是贾宝玉的表妹，同样薛宝钗和贾宝玉也有血缘关系，可见在古代近亲结婚是一件十分平常的事情，不仅仅普通老百姓是这样，就连皇氏以也是这样认为的，吕雉曾经就把自己的外孙女嫁给自己的儿子，这样一来他们的辈分全部都乱了，但是他们认为这是很正常的事情，用我们现在的眼光来看，对他们的行为真的是很不理解。
其实近亲结婚有两个弊端一个是道德问题，还有一个就是新生儿健康问题，近亲结婚的新生儿的确是不太健康，新生儿夭折的几率也会大大增加，但是古代的医疗卫生水平很落后，所以新生儿夭折是很正常的现象，就算是近亲结婚生下的孩子不健康甚至还夭折了，古人也不会想到是近亲结婚的缘故，因为那时候大家都这样做，也没有人提出近亲结婚生的孩子会不健康的观念，所以这个传统直到现在才改了过来。
这个最根本的原因就是古时候的科学技术水平落后，并不知道血缘太过相近不利于避免基因缺陷，容易生下有先天性问题的后代，所以古时候才有那么多的表兄妹情缘。
《魏书·高祖纪》记载：“夏殷不嫌一姓之婚，周制始绝同姓之娶。”
约周代开始，同姓不婚就已经慢慢有所形成，但是对于不同姓氏的表兄妹之间并没有太多的法定制约或民俗约成。古时代的女性有着“一门不出，二门不迈”的限制，婚姻之中更是无论男女都要遵从于“媒妁之约，父母之命”，在这两条限制之下，古时候的女性所能接触的到的同龄男性，除去自己的兄弟就是堂兄弟、表兄弟，在情窦初开时，自然对表兄弟有着异样的好感，而父母要给子女选择伴侣，当然是越知根知底的好，自己兄弟姐妹的儿女自然就成为最好的选择。著名诗人陆游和他的妻子唐婉就是表兄妹关系，《红楼梦》中，贾宝玉和林妹妹或是薛宝钗之间，都是有血缘关系的。
《国语郑语》：“气同则不继。”
古代近亲结婚并非没有生出有残疾的婴儿，只是以古代的医疗水平，这些智障儿童生存不下来，都很快夭折，以当时的技术水平并不能确定原因。时移世易，现代的科水技术不断发展，医疗水平亦如此，破解了人类DNA，研究基因排列等等，发现了近亲血脉之中，存在着相同的基因，如果这些基因存在着缺陷，一旦近亲结婚，这两个有缺陷的基因重合在一起，会大机率生产出有智障的儿童，不利于优生优育，所以才明文规定近亲不能得结婚。
其实早在古时候，就有从生理问题之上讨论近亲结婚的利弊，不过古代以家族为本，多讲究同姓之间为亲，所以堂兄弟姐妹之间视同一家，并没有把表兄弟姐妹列入其中，才导致古时代表兄妹之间结婚的特别多，不知你对于近亲结婚有什么看法？