水文五华区内有玉带河、沙朗河、西北沙河、迤六瓦恭河等主要河流。地下水分为松散堆积层孔隙水、基岩裂隙水(包括碎屑岩裂隙水、岩浆岩裂隙水、变质岩裂隙水)和碳酸盐岩裂隙岩溶水三类。降雨入渗和地表水渗漏是其补给的基本来源,主要以径流和泉水的形式排泄。
地貌地形:
五华区地势西北高、东南低,地形地貌复杂多样,海拔1670~2527千米之间,平均海拔1887米,境内有眠山、荷叶山、白泥山、锅盖山、圆通山、祖遍山、五华山等点状山体。
气候五华区属北纬低纬度亚热带高原山地季风气候,日照长、霜期短、年平均气温15℃,年均日照2200小时左右,无霜期240天以上,年降水量1035mm。