从芸薹属油菜花器官结构特征和授粉方式看，油菜基本上属于异花授粉作物，但不同物种在长期进化过程中，形成了异花授粉和自花授粉两种不同的繁殖方式。
油菜自然授粉的特性，在繁殖过程中按花粉的自然异交程度可分为3种：1.自花授粉
自然异交率很低，在5%以内。
2.常异花授粉自然异交率在5%～35%以内。
3.异花授粉自然异交率很高，达35%以上。
芸薹属油菜中，染色体数较低的物种，如白菜型油菜、黑芥、甘蓝和白芥等，一般自交亲和性较低；染色体数较多的物种，如甘蓝型油菜、芥菜型油菜和埃塞俄比亚芥，一般自交亲和性较高，自交能正常结实。
白菜型油菜自交结实率一般在5.9%～29%。自然异交率在54.4%～100%。例外的是印度白菜型黄籽沙逊油菜，自交亲和性较高。总体上，白菜型油菜自然授粉特性属于异花授粉。
白芥自交结实率为0，自然异交率为99.6%。
芥菜型油菜自交亲和与自交不亲和并存，自交结实率为48.5%，自然异交率4.3%～45.6%，自然授粉特性为异花授粉和常异花授粉。
甘蓝型油菜自交结实率在61.6%～70.9%之间，自然异交率多为6%～34%之间，自然授粉特性主要属于常异花授粉。但人工合成的甘蓝型油菜通常具有亲本种自交不亲和的特性。
不同油菜种质资源在生态特性和繁殖特性上的差异，决定了不同种类甚至不同品种的繁殖方式。实际繁种中应首先考虑油菜种质的生态特性和生育期，选择具有适宜光、温和生育期条件的地域进行繁种。其次，要考虑所选繁种区的病、虫害流行情况，避免在病、虫害高发地区繁种。第三，更重要的要考虑繁种材料的繁殖特性，选择适宜的隔离繁殖方式和适宜大小繁种群体，对以异花授粉为主的白菜型油菜、甘蓝、黑芥和白芥等种质资源，一般可采用隔离网繁殖，繁种群体大小一般在100～150株，花期注意进行株间辅助授粉；对甘蓝型油菜、芥菜型油菜和埃塞俄比亚芥等常异花授粉为主的种类，也可采用隔离网繁殖，或套袋繁殖，繁种群体一般在80～100株之间。