研究内容、学科分类、性质不同。
研究内容不同：
1、化学是研究在分子、原子层次上研究物质的组成、性质、结构与变化规律，从而创造新物质的科学。
2、物理学是研究物质运动最一般规律和物质基本结构的学科。是关于大自然规律的知识；更广义地说，物理学探索分析大自然所发生的现象，以了解其规则。
学科分类不同：
物理学分为：
1、牛顿力学与分析力学研究物体机械运动的基本规律及关于时空相对性的规律。
2、电磁学与电动力学研究电磁现象，物质的电磁运动规律及电磁辐射等规律。
3、热力学与统计力学研究物质热运动的统计规律及其宏观表现。
4、狭义相对论研究物体的高速运动效应以及相关的动力学规律。
5、广义相对论研究在大质量物体附近，物体在强引力场下的动力学行为。
6、量子力学研究微观物质运动现象以及基本运动规律
此外，还有：粒子物理学、原子核物理学、原子与分子物理学、固体物理学、凝聚态物理学、激光物理学、等离子体物理学、地球物理学、生物物理学、天体物理学等等。
化学分为：
1、无机化学：元素化学、无机合成化学、无机高分子化学、无机固体化学、配位化学（即络合物化学）、同位素化学、生物无机化学、金属有机化学、金属酶化学等。
2、有机化学：普通有机化学、有机合成化学、金属和非金属有机化学、物理有机化学、生物有机化学、有机分析化学。
3、物理化学：结构化学、热化学、化学热力学、化学动力学、电化学、溶液理论、界面化学、胶体化学、量子化学、催化作用及其理论等。
4、分析化学：化学分析、仪器和新技术分析。包括性能测定、监控、各种光谱和光化学分析、各种电化学分析方法、质谱分析法、各种电镜、成像和形貌分析方法，
在线分析、活性分析、实时分析等，各种物理化学性能和生理活性的检测方法，萃取、离子交换、色谱、质谱等分离方法，分离分析联用、合成分离分析三联用等。
5、高分子化学：天然高分子化学、高分子合成化学、高分子物理化学、高聚物应用、高分子物理。
6、核化学：放射性元素化学、放射分析化学、辐射化学、同位素化学、核化学。
7、生物化学：一般生物化学、酶类、微生物化学、植物化学、免疫化学、发酵和生物工程、食品化学、煤化学等。
其它与化学有关的边缘学科还有：地球化学、海洋化学、大气化学、环境化学、宇宙化学、星际化学等。
性质不同：
物理：物理学是人们对无生命自然界中物质的转变的知识做出规律性的总结。这种运动和转变应有两种。一是早期人们通过感官视觉的延伸，二是近代人们通过发明创造供观察测量用的科学仪器，实验得出的结果，间接认识物质内部组成建立在的基础上。
物理学从研究角度及观点不同，可分为微观与宏观两部分，宏观是不分析微粒群中的单个作用效果而直接考虑整体效果，是最早期就已经出现的，微观物理学随着科技的发展理论逐渐完善。
化学：是物质在化学变化中表现出来的性质。如所属物质类别的化学通性：酸性、碱性、氧化性、还原性、热稳定性及一些其它特性。
参考资料来源：百度百科—化学
参考资料来源：百度百科—物理学
在物理学的领域中，研究的是宇宙的基本组成要素：物质、能量、空间、时间及它们的相互作用
化学（chemistry）是研究物质的组成、结构、性质、以及变化规律的科学。世界是由物质组成的，化学则是人类用以认识和改造物质世界的主要方法和手段之一，它是一门历史悠久而又富有活力的学科，它的成就是社会文明的重要标志。
“化学”一词，若单从字面解释就是“变化的科学”。化学如同物理一样皆为自然科学之基础科学。很多人称化学为“中心科学”(Central science)，它是研究物质的组成、结构、性质以及变化规律的科学。分子的破裂和原子的重新组合是化学变化的基础。