黄元吉真人羽化飞升之事迹，在修行界多有流传，“清代道家大师黄元吉圆寂时，当场于八仙桌上将色身隐化。” （圆智《恒河大手印讲义》）；道门流传，黄元吉真人“留形住世”六百余年，最后乃是奉命化身前来大开普度，于清末光绪年间，在四川讲道十余年，开创乐育堂法脉。（《乐育堂语录》跋、《道门语要》等）。
“黄元吉清光绪十年丙戌，在四川自流井讲道，最后解馆，弟子恭送馆外，黄当下飞升，徒众见之，皆痛哭流涕，始后悔往日蹉跎，未尝从师勇猛学道也。”（台湾李乐俅《访道语录》）。
乐育堂门内流传，黄元吉真人的确是在众弟子簇拥中，将肉身化为清风（清风者，视之不见搏之不得也，比喻无形无相之先天一炁；“清风成就”是羽化的最高表现之一，盖因有形则有生灭，所以清风成就比起其他化虹、化光之类有声有色的表象来，水平更为高绝），而融合到生生不息之大道（先天一炁）之中，真正是“事了拂衣去，不留身与名”，充分体现了道家之逍遥精神！
黄元吉先生之贡献，绝不仅仅体现在个人的修证上面，他在四川乐育堂讲学十余年，留下了道家隐仙派乐育堂法脉，为后来学者提供了一条实证大道之康庄门径。其讲课记录《乐育堂语录》一书，亲切平实，大泄天机；其亲著的《道德经注释》 一书，“以之为用，可以明心养性，可以入圣登真，可以明哲处世，可以治国平天下。守藏可用，仕隐咸宜。衡情而论，确为《道德经》解本中之不朽名著，而无论道家儒家，皆可奉为无上圣经，视作修圣修仙之不二法门也。 ”（台湾著名学者萧天石对黄元吉先生《道德经注释》的评价）。历代注释《道德经》者不下万家，而黄元吉真人的《道德经注释》被认为是最接近老子原意的注本，是历代《道德经》注本里面最好的版本之一（另一本是吕洞宾注释的《道德经秘注》）；而其另一著作《道门语要》则是传统丹法的简明提纲。
黄元吉先生开乐育堂法脉以来，依此而成道者不可计数。且不说“预知死期，无疾而终，自主掌握生死”的较低层次成就，光是有史可考的阳神成就、异香成就、金光成就者，就不下十人；而当代之大成就者、第四代赵德正先生，更是在1999年，将肉身化光而羽化，其成就与黄元吉祖师几乎一样，这就重复验证的大道之真实不虚！
