宏基因二代测序方法相较其他方法有哪些优劣？

Question

如题所述

Answer 1

二代测序与其他方法相比就如用网捕鱼和鱼竿钓鱼，可将“致病菌、定植菌、罕见菌及未知菌”统统收入渔网。具有无需假设，无偏倚检测，高通量和可检测新的未知病原体。但是劣势就是相对其他方法，价格比较高，解读难度相对较大。
答：
1） 费用方面：相较于传统检测方法，费用高出几倍，但随着技术优化，宏基因测序成本也在不断降低；
2） 解读方面：二代测序与其他方法相比就如用网捕鱼和鱼竿钓鱼，可将“致病菌、定植菌、罕见菌及未知菌”统统收入渔网，可检出上万种微生物，因此如何“万里挑一，锁定目标”便成了一个棘手的问题，目前该领域机构面对这一挑战，致力于组建专业的专家团队，并进一步与临床医生密切沟通，依据多层次、多方面证据，“抽丝剥茧，查获真凶”，帮助临床精准诊断；
3） 技术方面：宏基因组的临床应用仍有诸多问题待解决，如RNA易降解，人源基因组干扰，特殊病原体的核酸提取如胞内菌、真菌、结核杆菌，背景菌的干扰，微生物基因组数据库等问题，目前相关研究机构均将以上问题作为攻克方向，不断地努力优化提升，争取突破宏基因检测技术壁垒，进一步提升阳性率。