因为杨秀清平日里作威作福惯了，他不仅仅光是欺凌天王洪秀全，更是欺负太平天国的其它王，这里面有北王韦昌辉，翼王石达开，燕王秦日纲，所以说东王杨秀清惹得人太多了，以至于墙倒众人推。
杨秀清经常假托天父下凡，然后训斥天王洪秀全，让洪秀全很没有面子，其次杨秀清变本加厉，想要和天王洪秀全平起平坐，这使得天王洪秀全忍无可忍，决心除掉杨秀清。
因此天王洪秀全下旨命令与杨秀清有矛盾的北王韦昌辉和燕王秦日纲星夜回京，韦昌辉这个时候正在江西督师，接到天王的旨意，明白了天王的企图，因此召集了3000将士昼夜兼程，赶回天京，遇到也回京的秦日纲，双方商量之后，一起入京了，当时主持城防的人是东王杨秀清的部下，但是这个部下是天王洪秀全安插在东王杨秀清的眼线，这个部下放北王韦昌辉和燕王秦日纲两个人顺利入京。
北王韦昌辉和燕王秦日纲两人进城之后，在很短的时间里，就控制了东王府的大街小巷，把整个东王府围的水泄不通，随后，北王韦昌辉带领部下，直接杀入东王府，将东王府杨秀清的家属和府中官员，全部杀光。
整个过程干净利落，打了东王杨秀清一个措手不及，东王杨秀清到死也没有想到自己这些一起出生入死的弟兄们，会将刀口向内，指向了他，但是究其原因，还不是因为杨秀清过于狂妄跋扈，与太平天国里其他的将领结缘太深，说到底还是咎由自取。
而东王杨秀清之死，并没有结束，后续北王韦昌辉和燕王秦日纲又将刀口指向了翼王石达开，将他的家里人杀戮殆尽，这就引发了太平天国更大的动乱，天王洪秀全为了平息这次动乱，也为了抚平翼王石达开的情绪，因此将这次开启杀戮之路的北王韦昌辉和燕王秦日纲全部不处死，虽然处死了首犯，让石达开的愤怒情绪得到了暂时的平抚，但是这京师的动乱，已经让天王与这些将领之间离心离德了，天国已经开始走下坡路了。
我们纵观整个天京内讧，手握实权的杨秀清，首先没有想到天王洪秀全会对他下死手，并且他的属下里竟然会有洪秀全的眼线，和北王韦昌辉和燕王秦日纲里应外合，打了东王杨秀清一个措手不及，都没有反应过来，就已经身首异处了。
而这个天京内讧最大的受益者就是天王洪秀全，他将所有的权利收回到了手中，成为了天国最高的军国统治者，也成为了上帝唯一的一个代言人！
在太平天国内部，权力关系十分复杂。主要权力都掌握在杨秀清手中。
定都天京后，洪秀全主要工作有两项：一是监督建造、装修天王府；二是享受后宫960名美女。
作为最高领导人，管理着与清朝对峙的半壁江山，洪秀全所从事的这两项工作，确实可以称得上“不务正业”。
表面上看起来，洪秀全十分享受这两项工作，其实，他的内心具有很多不满。
洪秀全一直在关注太平天国形势的发展，密切注意各路将领的动态。
洪秀全一直在等待机会，等待将杨秀清一招毙命的机会。
天父附身东王，天王高呼万岁
1856年6月，围困天京3年的清军江南大营，终于被太平军攻破。
太平天国上上下下都沉浸在胜利的喜悦中，尤其是东王杨秀清，更是忘乎所以、得意忘形、想入非非。
杨秀清派人告诉洪秀全，天父下凡了，要求天王速速赶到东王府。
到了东王府，洪秀全看到杨秀清端坐在东王宝座上。
杨秀清命令洪秀全：看见天父，如何不下跪？
洪秀全跪下。
杨秀清说：你与东王都是我的儿子，为了打江山，你们劳苦功高。你是万岁，东王岂能是九千岁？
洪秀全大声回答：东王应该万岁。
“天父”杨秀清十分高兴，对洪秀全说：好了，我回上天了。
“天父”回天后，洪秀全回到天王府，虽然心中闷闷不乐，但是，面子上没有丝毫表现。
陈承瑢的密报，让天王洪秀全再也不能无动于衷了。
东王意欲篡位，北王血洗天京
太平天国在天京建都后，杨秀清极其看重陈承瑢，军国大事全部由陈承瑢上传下达。
东王命令陈承瑢到天王府去，要求洪秀全到东王府来。
陈承瑢借此机会，向天王洪秀全告密：东王企图杀死天王。
天王洪秀全担心自己被杀，派人将密诏分别送给北王韦昌辉、燕王秦日纲、以及翼王石达开，命令他们火速返回京城，剿杀东王杨秀清。
三王接到密召后，北王韦昌辉行动最为迅速。
北王韦昌辉亲率3000精锐部队，急行军赶到天京。1856年9月4日，半夜时分，在天京城外，韦昌辉与燕王秦日纲会合。
陈承瑢从城内打开城门，迎接韦昌辉、秦日纲军队进入城内。
在一天中最黑暗的时刻，韦昌辉与秦日纲率领军队，对东王府发动突然袭击。
东王杨秀清及其部下措手不及，伤亡惨重。
韦昌辉杀死东王杨秀清；东王府内上下人等被杀死4000多人。东王府血流成河。
北王韦昌辉大肆绞杀东王府余党，血洗南京城。
短短时间内，东王府相关将士以及百姓被杀死2万多人，血腥味充斥了南京城。
杨秀清手握实权，是太平天国实际上的最高统治者，为什么被“不务正业”的洪秀全派人彻底消灭了呢？